Protein–RNA interactions for Protein: P17919

Hoxb1, Homeobox protein Hox-B1, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb1P17919 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Hoxb1P17919 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Hoxb1P17919 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Hoxb1P17919 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Hoxb1P17919 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Hoxb1P17919 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Hoxb1P17919 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Hoxb1P17919 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Hoxb1P17919 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Hoxb1P17919 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Hoxb1P17919 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Hoxb1P17919 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Hoxb1P17919 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Hoxb1P17919 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Hoxb1P17919 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Hoxb1P17919 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Hoxb1P17919 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Hoxb1P17919 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Hoxb1P17919 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Hoxb1P17919 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
Hoxb1P17919 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Hoxb1P17919 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Hoxb1P17919 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Hoxb1P17919 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Hoxb1P17919 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Hoxb1P17919 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Hoxb1P17919 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Hoxb1P17919 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Hoxb1P17919 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Hoxb1P17919 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Hoxb1P17919 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Hoxb1P17919 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Hoxb1P17919 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Hoxb1P17919 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hoxb1P17919 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hoxb1P17919 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hoxb1P17919 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hoxb1P17919 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hoxb1P17919 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hoxb1P17919 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hoxb1P17919 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hoxb1P17919 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Hoxb1P17919 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hoxb1P17919 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hoxb1P17919 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hoxb1P17919 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hoxb1P17919 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hoxb1P17919 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Hoxb1P17919 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hoxb1P17919 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hoxb1P17919 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hoxb1P17919 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hoxb1P17919 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hoxb1P17919 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hoxb1P17919 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hoxb1P17919 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hoxb1P17919 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hoxb1P17919 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
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Hoxb1P17919 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hoxb1P17919 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hoxb1P17919 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hoxb1P17919 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Hoxb1P17919 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hoxb1P17919 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Hoxb1P17919 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hoxb1P17919 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hoxb1P17919 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hoxb1P17919 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hoxb1P17919 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hoxb1P17919 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hoxb1P17919 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hoxb1P17919 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hoxb1P17919 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hoxb1P17919 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hoxb1P17919 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hoxb1P17919 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hoxb1P17919 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hoxb1P17919 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hoxb1P17919 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hoxb1P17919 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hoxb1P17919 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hoxb1P17919 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hoxb1P17919 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hoxb1P17919 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hoxb1P17919 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hoxb1P17919 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hoxb1P17919 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hoxb1P17919 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hoxb1P17919 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hoxb1P17919 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hoxb1P17919 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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