Protein–RNA interactions for Protein: P16546

Sptan1, Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,472 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sptan1P16546 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sptan1P16546 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sptan1P16546 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sptan1P16546 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sptan1P16546 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sptan1P16546 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sptan1P16546 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sptan1P16546 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sptan1P16546 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sptan1P16546 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Sptan1P16546 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sptan1P16546 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sptan1P16546 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sptan1P16546 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sptan1P16546 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sptan1P16546 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sptan1P16546 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sptan1P16546 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sptan1P16546 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sptan1P16546 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sptan1P16546 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sptan1P16546 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sptan1P16546 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sptan1P16546 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sptan1P16546 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Sptan1P16546 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sptan1P16546 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sptan1P16546 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sptan1P16546 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sptan1P16546 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sptan1P16546 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sptan1P16546 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sptan1P16546 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sptan1P16546 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sptan1P16546 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sptan1P16546 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sptan1P16546 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sptan1P16546 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Sptan1P16546 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Sptan1P16546 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC14.58□□□□□ -0.07
Sptan1P16546 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC14.58□□□□□ -0.07
Sptan1P16546 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Sptan1P16546 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Sptan1P16546 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Sptan1P16546 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Sptan1P16546 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Sptan1P16546 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Sptan1P16546 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sptan1P16546 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sptan1P16546 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sptan1P16546 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sptan1P16546 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sptan1P16546 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Sptan1P16546 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sptan1P16546 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sptan1P16546 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sptan1P16546 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sptan1P16546 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Sptan1P16546 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sptan1P16546 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sptan1P16546 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sptan1P16546 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sptan1P16546 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sptan1P16546 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sptan1P16546 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sptan1P16546 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sptan1P16546 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sptan1P16546 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sptan1P16546 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sptan1P16546 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sptan1P16546 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sptan1P16546 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sptan1P16546 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Sptan1P16546 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sptan1P16546 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sptan1P16546 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sptan1P16546 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sptan1P16546 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sptan1P16546 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sptan1P16546 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sptan1P16546 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sptan1P16546 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Sptan1P16546 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sptan1P16546 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sptan1P16546 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sptan1P16546 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sptan1P16546 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sptan1P16546 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sptan1P16546 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sptan1P16546 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sptan1P16546 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sptan1P16546 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sptan1P16546 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sptan1P16546 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sptan1P16546 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sptan1P16546 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sptan1P16546 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sptan1P16546 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sptan1P16546 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sptan1P16546 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
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