Protein–RNA interactions for Protein: P16305

Gabra6, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-6, mousemouse

Predictions only

Length 453 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabra6P16305 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gabra6P16305 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gabra6P16305 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gabra6P16305 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gabra6P16305 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gabra6P16305 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gabra6P16305 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gabra6P16305 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gabra6P16305 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Gabra6P16305 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Gabra6P16305 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gabra6P16305 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Gabra6P16305 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gabra6P16305 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gabra6P16305 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Gabra6P16305 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gabra6P16305 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gabra6P16305 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gabra6P16305 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gabra6P16305 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gabra6P16305 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gabra6P16305 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gabra6P16305 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gabra6P16305 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gabra6P16305 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gabra6P16305 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gabra6P16305 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gabra6P16305 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gabra6P16305 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gabra6P16305 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gabra6P16305 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gabra6P16305 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gabra6P16305 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gabra6P16305 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gabra6P16305 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gabra6P16305 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gabra6P16305 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gabra6P16305 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gabra6P16305 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gabra6P16305 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gabra6P16305 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gabra6P16305 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gabra6P16305 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gabra6P16305 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gabra6P16305 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gabra6P16305 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gabra6P16305 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gabra6P16305 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gabra6P16305 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gabra6P16305 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gabra6P16305 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gabra6P16305 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gabra6P16305 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gabra6P16305 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gabra6P16305 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gabra6P16305 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Gabra6P16305 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gabra6P16305 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gabra6P16305 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gabra6P16305 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gabra6P16305 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gabra6P16305 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gabra6P16305 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gabra6P16305 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gabra6P16305 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gabra6P16305 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gabra6P16305 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gabra6P16305 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gabra6P16305 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gabra6P16305 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gabra6P16305 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gabra6P16305 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gabra6P16305 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gabra6P16305 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gabra6P16305 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gabra6P16305 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gabra6P16305 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gabra6P16305 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gabra6P16305 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gabra6P16305 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gabra6P16305 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gabra6P16305 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gabra6P16305 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gabra6P16305 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gabra6P16305 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gabra6P16305 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gabra6P16305 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gabra6P16305 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gabra6P16305 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Gabra6P16305 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gabra6P16305 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gabra6P16305 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gabra6P16305 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gabra6P16305 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gabra6P16305 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gabra6P16305 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gabra6P16305 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gabra6P16305 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gabra6P16305 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gabra6P16305 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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