Protein–RNA interactions for Protein: P16054

Prkce, Protein kinase C epsilon type, mousemouse

Predictions only

Length 737 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkceP16054 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PrkceP16054 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PrkceP16054 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PrkceP16054 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PrkceP16054 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PrkceP16054 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PrkceP16054 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PrkceP16054 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
PrkceP16054 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PrkceP16054 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PrkceP16054 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PrkceP16054 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PrkceP16054 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PrkceP16054 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PrkceP16054 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PrkceP16054 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PrkceP16054 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PrkceP16054 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PrkceP16054 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PrkceP16054 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PrkceP16054 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PrkceP16054 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PrkceP16054 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PrkceP16054 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PrkceP16054 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PrkceP16054 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PrkceP16054 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
PrkceP16054 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PrkceP16054 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PrkceP16054 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PrkceP16054 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PrkceP16054 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PrkceP16054 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PrkceP16054 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
PrkceP16054 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PrkceP16054 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PrkceP16054 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PrkceP16054 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PrkceP16054 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PrkceP16054 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
PrkceP16054 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PrkceP16054 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PrkceP16054 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PrkceP16054 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PrkceP16054 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PrkceP16054 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PrkceP16054 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PrkceP16054 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PrkceP16054 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PrkceP16054 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PrkceP16054 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PrkceP16054 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PrkceP16054 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PrkceP16054 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PrkceP16054 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PrkceP16054 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
PrkceP16054 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PrkceP16054 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PrkceP16054 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PrkceP16054 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PrkceP16054 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PrkceP16054 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PrkceP16054 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PrkceP16054 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PrkceP16054 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PrkceP16054 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PrkceP16054 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PrkceP16054 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PrkceP16054 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PrkceP16054 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
PrkceP16054 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PrkceP16054 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PrkceP16054 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
PrkceP16054 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PrkceP16054 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PrkceP16054 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PrkceP16054 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PrkceP16054 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PrkceP16054 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
PrkceP16054 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PrkceP16054 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PrkceP16054 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PrkceP16054 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PrkceP16054 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PrkceP16054 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PrkceP16054 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
PrkceP16054 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
PrkceP16054 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
PrkceP16054 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
PrkceP16054 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
PrkceP16054 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
PrkceP16054 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PrkceP16054 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PrkceP16054 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PrkceP16054 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PrkceP16054 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PrkceP16054 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PrkceP16054 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PrkceP16054 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PrkceP16054 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.8 ms