Protein–RNA interactions for Protein: P15620

Znf271, Zinc finger protein 271, mousemouse

Predictions only

Length 580 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf271P15620 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Znf271P15620 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Znf271P15620 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Znf271P15620 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Znf271P15620 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Znf271P15620 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Znf271P15620 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Znf271P15620 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Znf271P15620 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Znf271P15620 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Znf271P15620 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Znf271P15620 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Znf271P15620 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Znf271P15620 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Znf271P15620 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Znf271P15620 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Znf271P15620 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Znf271P15620 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Znf271P15620 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Znf271P15620 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Znf271P15620 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Znf271P15620 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Znf271P15620 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Znf271P15620 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Znf271P15620 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Znf271P15620 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Znf271P15620 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Znf271P15620 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Znf271P15620 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Znf271P15620 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Znf271P15620 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Znf271P15620 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Znf271P15620 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Znf271P15620 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Znf271P15620 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Znf271P15620 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Znf271P15620 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Znf271P15620 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Znf271P15620 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Znf271P15620 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Znf271P15620 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Znf271P15620 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Znf271P15620 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Znf271P15620 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Znf271P15620 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Znf271P15620 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Znf271P15620 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Znf271P15620 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Znf271P15620 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Znf271P15620 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Znf271P15620 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Znf271P15620 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Znf271P15620 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Znf271P15620 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Znf271P15620 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Znf271P15620 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Znf271P15620 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Znf271P15620 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Znf271P15620 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Znf271P15620 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Znf271P15620 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Znf271P15620 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Znf271P15620 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Znf271P15620 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Znf271P15620 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Znf271P15620 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Znf271P15620 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Znf271P15620 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Znf271P15620 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Znf271P15620 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Znf271P15620 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Znf271P15620 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Znf271P15620 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Znf271P15620 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Znf271P15620 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Znf271P15620 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Znf271P15620 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Znf271P15620 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Znf271P15620 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Znf271P15620 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Znf271P15620 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Znf271P15620 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Znf271P15620 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Znf271P15620 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Znf271P15620 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Znf271P15620 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Znf271P15620 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Znf271P15620 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Znf271P15620 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Znf271P15620 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Znf271P15620 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Znf271P15620 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Znf271P15620 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Znf271P15620 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Znf271P15620 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Znf271P15620 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Znf271P15620 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Znf271P15620 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Znf271P15620 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Znf271P15620 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms