Protein–RNA interactions for Protein: P13373

Vpreb2, Immunoglobulin omega chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb2P13373 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Vpreb2P13373 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Vpreb2P13373 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Vpreb2P13373 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Vpreb2P13373 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Vpreb2P13373 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Vpreb2P13373 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Vpreb2P13373 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Vpreb2P13373 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Vpreb2P13373 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Vpreb2P13373 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Vpreb2P13373 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Vpreb2P13373 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Vpreb2P13373 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Vpreb2P13373 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Vpreb2P13373 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Vpreb2P13373 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Vpreb2P13373 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Vpreb2P13373 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Vpreb2P13373 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Vpreb2P13373 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Vpreb2P13373 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Vpreb2P13373 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Vpreb2P13373 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Vpreb2P13373 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Vpreb2P13373 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Vpreb2P13373 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Vpreb2P13373 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Vpreb2P13373 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Vpreb2P13373 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Vpreb2P13373 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Vpreb2P13373 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Vpreb2P13373 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Vpreb2P13373 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Vpreb2P13373 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Vpreb2P13373 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Vpreb2P13373 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Vpreb2P13373 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Vpreb2P13373 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Vpreb2P13373 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Vpreb2P13373 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Vpreb2P13373 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Vpreb2P13373 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Vpreb2P13373 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Vpreb2P13373 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Vpreb2P13373 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Vpreb2P13373 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Vpreb2P13373 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Vpreb2P13373 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Vpreb2P13373 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Vpreb2P13373 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Vpreb2P13373 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Vpreb2P13373 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Vpreb2P13373 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Vpreb2P13373 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Vpreb2P13373 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Vpreb2P13373 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Vpreb2P13373 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Vpreb2P13373 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Vpreb2P13373 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Vpreb2P13373 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Vpreb2P13373 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Vpreb2P13373 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Vpreb2P13373 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Vpreb2P13373 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Vpreb2P13373 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Vpreb2P13373 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Vpreb2P13373 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Vpreb2P13373 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Vpreb2P13373 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Vpreb2P13373 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Vpreb2P13373 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Vpreb2P13373 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Vpreb2P13373 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Vpreb2P13373 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Vpreb2P13373 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Vpreb2P13373 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Vpreb2P13373 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Vpreb2P13373 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Vpreb2P13373 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Vpreb2P13373 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Vpreb2P13373 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Vpreb2P13373 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Vpreb2P13373 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Vpreb2P13373 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Vpreb2P13373 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Vpreb2P13373 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Vpreb2P13373 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Vpreb2P13373 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Vpreb2P13373 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Vpreb2P13373 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Vpreb2P13373 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Vpreb2P13373 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Vpreb2P13373 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Vpreb2P13373 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Vpreb2P13373 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Vpreb2P13373 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Vpreb2P13373 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Vpreb2P13373 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Vpreb2P13373 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms