Protein–RNA interactions for Protein: P12960

Cntn1, Contactin-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,020 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntn1P12960 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cntn1P12960 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cntn1P12960 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cntn1P12960 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cntn1P12960 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Cntn1P12960 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cntn1P12960 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cntn1P12960 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cntn1P12960 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cntn1P12960 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cntn1P12960 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cntn1P12960 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cntn1P12960 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cntn1P12960 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cntn1P12960 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cntn1P12960 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cntn1P12960 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cntn1P12960 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cntn1P12960 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cntn1P12960 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cntn1P12960 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cntn1P12960 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cntn1P12960 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cntn1P12960 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cntn1P12960 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cntn1P12960 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cntn1P12960 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cntn1P12960 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cntn1P12960 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cntn1P12960 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Cntn1P12960 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cntn1P12960 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cntn1P12960 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cntn1P12960 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cntn1P12960 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cntn1P12960 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cntn1P12960 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cntn1P12960 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Cntn1P12960 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Cntn1P12960 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cntn1P12960 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cntn1P12960 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Cntn1P12960 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cntn1P12960 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cntn1P12960 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cntn1P12960 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Cntn1P12960 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Cntn1P12960 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Cntn1P12960 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Cntn1P12960 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Cntn1P12960 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cntn1P12960 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cntn1P12960 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cntn1P12960 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cntn1P12960 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cntn1P12960 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cntn1P12960 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cntn1P12960 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cntn1P12960 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cntn1P12960 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cntn1P12960 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cntn1P12960 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cntn1P12960 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cntn1P12960 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cntn1P12960 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cntn1P12960 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cntn1P12960 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cntn1P12960 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cntn1P12960 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cntn1P12960 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cntn1P12960 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cntn1P12960 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cntn1P12960 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cntn1P12960 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Cntn1P12960 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cntn1P12960 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cntn1P12960 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cntn1P12960 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cntn1P12960 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cntn1P12960 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cntn1P12960 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cntn1P12960 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cntn1P12960 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cntn1P12960 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cntn1P12960 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cntn1P12960 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cntn1P12960 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Cntn1P12960 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cntn1P12960 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cntn1P12960 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cntn1P12960 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Cntn1P12960 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cntn1P12960 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cntn1P12960 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cntn1P12960 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cntn1P12960 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cntn1P12960 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cntn1P12960 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cntn1P12960 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cntn1P12960 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.7 ms