Protein–RNA interactions for Protein: P12813

Nr4a1, Nuclear receptor subfamily 4 group A member 1, mousemouse

Predictions only

Length 601 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nr4a1P12813 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nr4a1P12813 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nr4a1P12813 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nr4a1P12813 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nr4a1P12813 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nr4a1P12813 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nr4a1P12813 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nr4a1P12813 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nr4a1P12813 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nr4a1P12813 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nr4a1P12813 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nr4a1P12813 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nr4a1P12813 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nr4a1P12813 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Nr4a1P12813 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nr4a1P12813 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Nr4a1P12813 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nr4a1P12813 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nr4a1P12813 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nr4a1P12813 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nr4a1P12813 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nr4a1P12813 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nr4a1P12813 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nr4a1P12813 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nr4a1P12813 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nr4a1P12813 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nr4a1P12813 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nr4a1P12813 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nr4a1P12813 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nr4a1P12813 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nr4a1P12813 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nr4a1P12813 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nr4a1P12813 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nr4a1P12813 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nr4a1P12813 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nr4a1P12813 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Nr4a1P12813 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nr4a1P12813 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nr4a1P12813 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nr4a1P12813 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nr4a1P12813 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nr4a1P12813 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nr4a1P12813 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nr4a1P12813 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nr4a1P12813 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nr4a1P12813 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nr4a1P12813 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nr4a1P12813 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nr4a1P12813 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nr4a1P12813 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nr4a1P12813 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Nr4a1P12813 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nr4a1P12813 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nr4a1P12813 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nr4a1P12813 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nr4a1P12813 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nr4a1P12813 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nr4a1P12813 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Nr4a1P12813 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Nr4a1P12813 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Nr4a1P12813 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Nr4a1P12813 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Nr4a1P12813 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Nr4a1P12813 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nr4a1P12813 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nr4a1P12813 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nr4a1P12813 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nr4a1P12813 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nr4a1P12813 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nr4a1P12813 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Nr4a1P12813 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nr4a1P12813 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nr4a1P12813 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nr4a1P12813 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nr4a1P12813 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nr4a1P12813 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nr4a1P12813 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nr4a1P12813 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nr4a1P12813 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nr4a1P12813 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nr4a1P12813 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nr4a1P12813 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nr4a1P12813 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nr4a1P12813 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nr4a1P12813 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nr4a1P12813 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Nr4a1P12813 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Nr4a1P12813 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nr4a1P12813 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nr4a1P12813 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nr4a1P12813 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nr4a1P12813 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nr4a1P12813 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nr4a1P12813 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nr4a1P12813 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nr4a1P12813 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nr4a1P12813 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nr4a1P12813 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nr4a1P12813 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Nr4a1P12813 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms