Protein–RNA interactions for Protein: P12658

Calb1, Calbindin, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Calb1P12658 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Calb1P12658 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Calb1P12658 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Calb1P12658 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Calb1P12658 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Calb1P12658 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Calb1P12658 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Calb1P12658 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Calb1P12658 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Calb1P12658 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Calb1P12658 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Calb1P12658 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Calb1P12658 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Calb1P12658 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Calb1P12658 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Calb1P12658 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Calb1P12658 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Calb1P12658 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Calb1P12658 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Calb1P12658 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Calb1P12658 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Calb1P12658 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Calb1P12658 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Calb1P12658 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Calb1P12658 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Calb1P12658 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Calb1P12658 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Calb1P12658 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Calb1P12658 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Calb1P12658 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Calb1P12658 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Calb1P12658 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Calb1P12658 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Calb1P12658 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Calb1P12658 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Calb1P12658 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Calb1P12658 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Calb1P12658 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Calb1P12658 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Calb1P12658 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Calb1P12658 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Calb1P12658 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Calb1P12658 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Calb1P12658 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Calb1P12658 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Calb1P12658 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Calb1P12658 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Calb1P12658 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Calb1P12658 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Calb1P12658 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Calb1P12658 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
Calb1P12658 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Calb1P12658 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Calb1P12658 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Calb1P12658 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Calb1P12658 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Calb1P12658 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Calb1P12658 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Calb1P12658 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Calb1P12658 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Calb1P12658 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Calb1P12658 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Calb1P12658 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Calb1P12658 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Calb1P12658 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Calb1P12658 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Calb1P12658 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Calb1P12658 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Calb1P12658 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Calb1P12658 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Calb1P12658 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Calb1P12658 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Calb1P12658 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Calb1P12658 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Calb1P12658 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Calb1P12658 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Calb1P12658 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Calb1P12658 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Calb1P12658 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Calb1P12658 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Calb1P12658 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Calb1P12658 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Calb1P12658 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Calb1P12658 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Calb1P12658 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Calb1P12658 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Calb1P12658 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Calb1P12658 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Calb1P12658 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Calb1P12658 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Calb1P12658 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Calb1P12658 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Calb1P12658 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Calb1P12658 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Calb1P12658 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Calb1P12658 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Calb1P12658 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Calb1P12658 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Calb1P12658 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Calb1P12658 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms