Protein–RNA interactions for Protein: P12657

Chrm1, Muscarinic acetylcholine receptor M1, mousemouse

Predictions only

Length 460 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chrm1P12657 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Chrm1P12657 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Chrm1P12657 Gm29500-201ENSMUST00000185992 1344 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Chrm1P12657 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Chrm1P12657 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Chrm1P12657 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Chrm1P12657 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Chrm1P12657 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Chrm1P12657 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Chrm1P12657 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Chrm1P12657 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Chrm1P12657 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Chrm1P12657 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Chrm1P12657 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Chrm1P12657 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Chrm1P12657 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Chrm1P12657 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Chrm1P12657 Gm36943-201ENSMUST00000194422 282 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Chrm1P12657 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Chrm1P12657 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Chrm1P12657 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Chrm1P12657 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Chrm1P12657 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Chrm1P12657 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Chrm1P12657 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Chrm1P12657 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Chrm1P12657 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Chrm1P12657 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Chrm1P12657 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Chrm1P12657 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Chrm1P12657 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Chrm1P12657 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Chrm1P12657 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Chrm1P12657 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Chrm1P12657 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Chrm1P12657 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Chrm1P12657 4933405E24Rik-201ENSMUST00000131019 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Chrm1P12657 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Chrm1P12657 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Chrm1P12657 Trdn-202ENSMUST00000217779 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Chrm1P12657 Gnat3-201ENSMUST00000030561 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Chrm1P12657 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Chrm1P12657 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Chrm1P12657 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Chrm1P12657 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Chrm1P12657 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Chrm1P12657 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Chrm1P12657 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Chrm1P12657 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Chrm1P12657 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Chrm1P12657 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Chrm1P12657 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Chrm1P12657 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Chrm1P12657 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Chrm1P12657 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Chrm1P12657 Ica1-202ENSMUST00000115518 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Chrm1P12657 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Chrm1P12657 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Chrm1P12657 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Chrm1P12657 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Chrm1P12657 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Chrm1P12657 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Chrm1P12657 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Chrm1P12657 AC132446.1-201ENSMUST00000222655 226 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Chrm1P12657 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Chrm1P12657 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Chrm1P12657 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Chrm1P12657 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Chrm1P12657 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Chrm1P12657 Olfr128-201ENSMUST00000080231 1050 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Chrm1P12657 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Chrm1P12657 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Chrm1P12657 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Chrm1P12657 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Chrm1P12657 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Chrm1P12657 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Chrm1P12657 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Chrm1P12657 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Chrm1P12657 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Chrm1P12657 Gm38114-201ENSMUST00000191877 1232 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Chrm1P12657 Gm43037-201ENSMUST00000196808 250 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Chrm1P12657 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Chrm1P12657 AC124742.1-201ENSMUST00000219909 547 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Chrm1P12657 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Chrm1P12657 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Chrm1P12657 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Chrm1P12657 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Chrm1P12657 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Chrm1P12657 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Chrm1P12657 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Chrm1P12657 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Chrm1P12657 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Chrm1P12657 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Chrm1P12657 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Chrm1P12657 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Chrm1P12657 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Chrm1P12657 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Chrm1P12657 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Chrm1P12657 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
Chrm1P12657 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms