Protein–RNA interactions for Protein: P11725

Otc, Ornithine carbamoyltransferase, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OtcP11725 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
OtcP11725 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
OtcP11725 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
OtcP11725 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
OtcP11725 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
OtcP11725 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
OtcP11725 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
OtcP11725 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
OtcP11725 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
OtcP11725 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
OtcP11725 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
OtcP11725 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
OtcP11725 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
OtcP11725 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
OtcP11725 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
OtcP11725 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
OtcP11725 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
OtcP11725 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
OtcP11725 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
OtcP11725 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
OtcP11725 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
OtcP11725 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
OtcP11725 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
OtcP11725 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
OtcP11725 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
OtcP11725 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
OtcP11725 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
OtcP11725 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
OtcP11725 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
OtcP11725 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
OtcP11725 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
OtcP11725 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
OtcP11725 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
OtcP11725 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
OtcP11725 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
OtcP11725 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
OtcP11725 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
OtcP11725 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
OtcP11725 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
OtcP11725 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
OtcP11725 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
OtcP11725 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
OtcP11725 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
OtcP11725 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
OtcP11725 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
OtcP11725 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
OtcP11725 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
OtcP11725 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
OtcP11725 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
OtcP11725 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
OtcP11725 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
OtcP11725 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
OtcP11725 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
OtcP11725 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
OtcP11725 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
OtcP11725 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
OtcP11725 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
OtcP11725 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
OtcP11725 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
OtcP11725 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
OtcP11725 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
OtcP11725 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
OtcP11725 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
OtcP11725 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
OtcP11725 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
OtcP11725 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
OtcP11725 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
OtcP11725 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
OtcP11725 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
OtcP11725 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
OtcP11725 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
OtcP11725 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
OtcP11725 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
OtcP11725 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
OtcP11725 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
OtcP11725 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
OtcP11725 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
OtcP11725 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
OtcP11725 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
OtcP11725 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
OtcP11725 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
OtcP11725 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
OtcP11725 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
OtcP11725 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
OtcP11725 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
OtcP11725 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
OtcP11725 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
OtcP11725 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
OtcP11725 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
OtcP11725 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
OtcP11725 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
OtcP11725 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
OtcP11725 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
OtcP11725 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
OtcP11725 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
OtcP11725 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
OtcP11725 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
OtcP11725 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
OtcP11725 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
OtcP11725 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.8 ms