Protein–RNA interactions for Protein: P11679

Krt8, Keratin, type II cytoskeletal 8, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt8P11679 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Krt8P11679 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Krt8P11679 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Krt8P11679 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Krt8P11679 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Krt8P11679 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Krt8P11679 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Krt8P11679 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Krt8P11679 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Krt8P11679 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Krt8P11679 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Krt8P11679 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Krt8P11679 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Krt8P11679 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Krt8P11679 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Krt8P11679 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Krt8P11679 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Krt8P11679 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Krt8P11679 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Krt8P11679 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Krt8P11679 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Krt8P11679 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Krt8P11679 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Krt8P11679 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Krt8P11679 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Krt8P11679 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Krt8P11679 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Krt8P11679 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Krt8P11679 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Krt8P11679 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Krt8P11679 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Krt8P11679 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Krt8P11679 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Krt8P11679 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Krt8P11679 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Krt8P11679 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Krt8P11679 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Krt8P11679 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Krt8P11679 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Krt8P11679 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Krt8P11679 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Krt8P11679 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Krt8P11679 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Krt8P11679 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Krt8P11679 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Krt8P11679 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Krt8P11679 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Krt8P11679 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Krt8P11679 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Krt8P11679 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Krt8P11679 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Krt8P11679 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Krt8P11679 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Krt8P11679 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Krt8P11679 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Krt8P11679 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Krt8P11679 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Krt8P11679 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Krt8P11679 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Krt8P11679 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Krt8P11679 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Krt8P11679 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Krt8P11679 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Krt8P11679 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Krt8P11679 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Krt8P11679 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Krt8P11679 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Krt8P11679 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Krt8P11679 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Krt8P11679 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Krt8P11679 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Krt8P11679 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Krt8P11679 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Krt8P11679 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Krt8P11679 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Krt8P11679 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Krt8P11679 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Krt8P11679 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Krt8P11679 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Krt8P11679 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Krt8P11679 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Krt8P11679 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Krt8P11679 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Krt8P11679 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Krt8P11679 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Krt8P11679 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Krt8P11679 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Krt8P11679 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Krt8P11679 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Krt8P11679 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Krt8P11679 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Krt8P11679 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Krt8P11679 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Krt8P11679 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Krt8P11679 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Krt8P11679 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Krt8P11679 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Krt8P11679 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Krt8P11679 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Krt8P11679 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms