Protein–RNA interactions for Protein: P11378

Tnp2, Nuclear transition protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnp2P11378 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Tnp2P11378 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Tnp2P11378 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Tnp2P11378 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Tnp2P11378 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Tnp2P11378 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Tnp2P11378 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Tnp2P11378 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Tnp2P11378 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Tnp2P11378 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Tnp2P11378 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Tnp2P11378 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Tnp2P11378 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Tnp2P11378 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Tnp2P11378 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Tnp2P11378 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Tnp2P11378 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Tnp2P11378 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Tnp2P11378 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Tnp2P11378 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Tnp2P11378 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Tnp2P11378 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Tnp2P11378 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Tnp2P11378 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Tnp2P11378 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Tnp2P11378 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Tnp2P11378 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Tnp2P11378 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Tnp2P11378 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Tnp2P11378 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Tnp2P11378 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Tnp2P11378 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Tnp2P11378 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Tnp2P11378 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Tnp2P11378 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Tnp2P11378 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Tnp2P11378 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Tnp2P11378 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Tnp2P11378 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Tnp2P11378 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Tnp2P11378 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Tnp2P11378 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Tnp2P11378 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Tnp2P11378 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Tnp2P11378 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Tnp2P11378 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Tnp2P11378 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Tnp2P11378 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Tnp2P11378 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Tnp2P11378 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Tnp2P11378 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Tnp2P11378 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Tnp2P11378 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tnp2P11378 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tnp2P11378 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tnp2P11378 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tnp2P11378 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tnp2P11378 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tnp2P11378 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tnp2P11378 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tnp2P11378 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tnp2P11378 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tnp2P11378 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tnp2P11378 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
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Tnp2P11378 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
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Tnp2P11378 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Tnp2P11378 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Tnp2P11378 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Tnp2P11378 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Tnp2P11378 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Tnp2P11378 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tnp2P11378 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tnp2P11378 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tnp2P11378 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tnp2P11378 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Tnp2P11378 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Tnp2P11378 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tnp2P11378 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tnp2P11378 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tnp2P11378 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tnp2P11378 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tnp2P11378 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Tnp2P11378 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC10.65□□□□□ -0.71
Tnp2P11378 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC10.65□□□□□ -0.71
Tnp2P11378 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Tnp2P11378 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Tnp2P11378 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Tnp2P11378 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Tnp2P11378 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tnp2P11378 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
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