Protein–RNA interactions for Protein: P10923

Spp1, Osteopontin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 294 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spp1P10923 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Spp1P10923 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Spp1P10923 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Spp1P10923 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Spp1P10923 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Spp1P10923 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Spp1P10923 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Spp1P10923 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Spp1P10923 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Spp1P10923 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Spp1P10923 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Spp1P10923 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Spp1P10923 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Spp1P10923 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Spp1P10923 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Spp1P10923 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Spp1P10923 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Spp1P10923 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Spp1P10923 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Spp1P10923 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Spp1P10923 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Spp1P10923 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Spp1P10923 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Spp1P10923 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Spp1P10923 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Spp1P10923 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Spp1P10923 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Spp1P10923 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Spp1P10923 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Spp1P10923 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Spp1P10923 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Spp1P10923 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Spp1P10923 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Spp1P10923 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Spp1P10923 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Spp1P10923 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Spp1P10923 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Spp1P10923 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Spp1P10923 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Spp1P10923 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Spp1P10923 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Spp1P10923 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Spp1P10923 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Spp1P10923 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Spp1P10923 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Spp1P10923 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Spp1P10923 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Spp1P10923 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Spp1P10923 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Spp1P10923 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Spp1P10923 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Spp1P10923 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Spp1P10923 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Spp1P10923 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Spp1P10923 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Spp1P10923 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Spp1P10923 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Spp1P10923 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Spp1P10923 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Spp1P10923 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Spp1P10923 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Spp1P10923 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Spp1P10923 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Spp1P10923 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Spp1P10923 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Spp1P10923 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Spp1P10923 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Spp1P10923 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Spp1P10923 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Spp1P10923 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Spp1P10923 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Spp1P10923 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Spp1P10923 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Spp1P10923 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Spp1P10923 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Spp1P10923 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Spp1P10923 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Spp1P10923 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Spp1P10923 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Spp1P10923 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Spp1P10923 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Spp1P10923 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Spp1P10923 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Spp1P10923 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Spp1P10923 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Spp1P10923 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Spp1P10923 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Spp1P10923 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Spp1P10923 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Spp1P10923 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Spp1P10923 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Spp1P10923 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Spp1P10923 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Spp1P10923 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Spp1P10923 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Spp1P10923 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Spp1P10923 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Spp1P10923 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Spp1P10923 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Spp1P10923 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms