Protein–RNA interactions for Protein: P10628

Hoxd4, Homeobox protein Hox-D4, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd4P10628 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hoxd4P10628 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hoxd4P10628 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hoxd4P10628 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Hoxd4P10628 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hoxd4P10628 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hoxd4P10628 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hoxd4P10628 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hoxd4P10628 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hoxd4P10628 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hoxd4P10628 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hoxd4P10628 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hoxd4P10628 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hoxd4P10628 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hoxd4P10628 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hoxd4P10628 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hoxd4P10628 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hoxd4P10628 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hoxd4P10628 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hoxd4P10628 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hoxd4P10628 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hoxd4P10628 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hoxd4P10628 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hoxd4P10628 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hoxd4P10628 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Hoxd4P10628 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hoxd4P10628 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hoxd4P10628 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hoxd4P10628 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Hoxd4P10628 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hoxd4P10628 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hoxd4P10628 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hoxd4P10628 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hoxd4P10628 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hoxd4P10628 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hoxd4P10628 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hoxd4P10628 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hoxd4P10628 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hoxd4P10628 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hoxd4P10628 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hoxd4P10628 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hoxd4P10628 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hoxd4P10628 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hoxd4P10628 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hoxd4P10628 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hoxd4P10628 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hoxd4P10628 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hoxd4P10628 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hoxd4P10628 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Hoxd4P10628 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hoxd4P10628 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hoxd4P10628 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hoxd4P10628 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hoxd4P10628 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hoxd4P10628 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hoxd4P10628 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hoxd4P10628 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hoxd4P10628 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hoxd4P10628 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hoxd4P10628 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hoxd4P10628 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hoxd4P10628 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hoxd4P10628 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hoxd4P10628 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hoxd4P10628 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hoxd4P10628 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hoxd4P10628 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hoxd4P10628 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hoxd4P10628 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hoxd4P10628 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hoxd4P10628 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hoxd4P10628 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hoxd4P10628 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hoxd4P10628 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hoxd4P10628 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hoxd4P10628 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hoxd4P10628 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hoxd4P10628 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hoxd4P10628 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hoxd4P10628 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hoxd4P10628 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hoxd4P10628 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hoxd4P10628 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hoxd4P10628 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hoxd4P10628 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hoxd4P10628 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hoxd4P10628 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hoxd4P10628 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hoxd4P10628 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hoxd4P10628 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hoxd4P10628 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hoxd4P10628 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hoxd4P10628 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hoxd4P10628 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hoxd4P10628 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hoxd4P10628 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hoxd4P10628 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hoxd4P10628 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hoxd4P10628 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hoxd4P10628 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms