Protein–RNA interactions for Protein: P10493

Nid1, Nidogen-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,245 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nid1P10493 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nid1P10493 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nid1P10493 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Nid1P10493 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nid1P10493 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nid1P10493 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nid1P10493 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nid1P10493 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nid1P10493 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nid1P10493 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nid1P10493 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nid1P10493 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nid1P10493 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nid1P10493 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nid1P10493 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nid1P10493 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nid1P10493 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nid1P10493 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nid1P10493 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nid1P10493 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nid1P10493 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nid1P10493 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nid1P10493 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nid1P10493 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nid1P10493 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nid1P10493 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nid1P10493 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nid1P10493 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nid1P10493 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nid1P10493 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nid1P10493 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nid1P10493 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nid1P10493 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nid1P10493 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nid1P10493 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nid1P10493 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Nid1P10493 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Nid1P10493 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Nid1P10493 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Nid1P10493 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nid1P10493 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nid1P10493 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nid1P10493 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nid1P10493 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nid1P10493 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nid1P10493 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nid1P10493 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nid1P10493 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nid1P10493 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nid1P10493 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nid1P10493 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Nid1P10493 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nid1P10493 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nid1P10493 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nid1P10493 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nid1P10493 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nid1P10493 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nid1P10493 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nid1P10493 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nid1P10493 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nid1P10493 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nid1P10493 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nid1P10493 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nid1P10493 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nid1P10493 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nid1P10493 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nid1P10493 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nid1P10493 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nid1P10493 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nid1P10493 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nid1P10493 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nid1P10493 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nid1P10493 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nid1P10493 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nid1P10493 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nid1P10493 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Nid1P10493 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nid1P10493 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Nid1P10493 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Nid1P10493 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nid1P10493 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nid1P10493 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nid1P10493 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nid1P10493 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nid1P10493 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nid1P10493 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nid1P10493 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nid1P10493 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nid1P10493 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nid1P10493 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Nid1P10493 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nid1P10493 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nid1P10493 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nid1P10493 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nid1P10493 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nid1P10493 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nid1P10493 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Nid1P10493 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nid1P10493 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nid1P10493 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms