Protein–RNA interactions for Protein: P10284

Hoxb4, Homeobox protein Hox-B4, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb4P10284 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hoxb4P10284 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hoxb4P10284 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hoxb4P10284 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hoxb4P10284 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hoxb4P10284 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hoxb4P10284 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hoxb4P10284 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hoxb4P10284 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hoxb4P10284 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hoxb4P10284 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hoxb4P10284 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hoxb4P10284 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hoxb4P10284 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hoxb4P10284 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hoxb4P10284 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hoxb4P10284 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hoxb4P10284 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hoxb4P10284 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hoxb4P10284 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Hoxb4P10284 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hoxb4P10284 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hoxb4P10284 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hoxb4P10284 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hoxb4P10284 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hoxb4P10284 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Hoxb4P10284 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hoxb4P10284 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hoxb4P10284 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hoxb4P10284 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hoxb4P10284 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hoxb4P10284 Gm38134-201ENSMUST00000191858 1234 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hoxb4P10284 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hoxb4P10284 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Hoxb4P10284 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Hoxb4P10284 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hoxb4P10284 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hoxb4P10284 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hoxb4P10284 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hoxb4P10284 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hoxb4P10284 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hoxb4P10284 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hoxb4P10284 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hoxb4P10284 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hoxb4P10284 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hoxb4P10284 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
Hoxb4P10284 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Hoxb4P10284 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hoxb4P10284 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hoxb4P10284 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hoxb4P10284 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hoxb4P10284 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hoxb4P10284 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hoxb4P10284 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Hoxb4P10284 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Hoxb4P10284 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Hoxb4P10284 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Hoxb4P10284 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hoxb4P10284 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hoxb4P10284 AC142191.1-201ENSMUST00000219217 699 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Hoxb4P10284 Thoc7-209ENSMUST00000225325 765 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Hoxb4P10284 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hoxb4P10284 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hoxb4P10284 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hoxb4P10284 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Hoxb4P10284 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hoxb4P10284 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Hoxb4P10284 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hoxb4P10284 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hoxb4P10284 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Hoxb4P10284 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hoxb4P10284 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hoxb4P10284 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hoxb4P10284 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Hoxb4P10284 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hoxb4P10284 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hoxb4P10284 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hoxb4P10284 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hoxb4P10284 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hoxb4P10284 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hoxb4P10284 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hoxb4P10284 Zfp1-201ENSMUST00000077791 1811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hoxb4P10284 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hoxb4P10284 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hoxb4P10284 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hoxb4P10284 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Hoxb4P10284 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Hoxb4P10284 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hoxb4P10284 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hoxb4P10284 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hoxb4P10284 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hoxb4P10284 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hoxb4P10284 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hoxb4P10284 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hoxb4P10284 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hoxb4P10284 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Hoxb4P10284 Gm14913-201ENSMUST00000120011 1093 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Hoxb4P10284 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Hoxb4P10284 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hoxb4P10284 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms