Protein–RNA interactions for Protein: P10085

Myod1, Myoblast determination protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Myod1P10085 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Myod1P10085 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Myod1P10085 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Myod1P10085 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Myod1P10085 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Myod1P10085 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Myod1P10085 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Myod1P10085 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Myod1P10085 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Myod1P10085 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Myod1P10085 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Myod1P10085 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Myod1P10085 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Myod1P10085 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Myod1P10085 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Myod1P10085 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Myod1P10085 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Myod1P10085 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Myod1P10085 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Myod1P10085 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Myod1P10085 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Myod1P10085 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Myod1P10085 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Myod1P10085 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Myod1P10085 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Myod1P10085 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Myod1P10085 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Myod1P10085 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Myod1P10085 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Myod1P10085 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Myod1P10085 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Myod1P10085 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Myod1P10085 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Myod1P10085 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Myod1P10085 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Myod1P10085 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Myod1P10085 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Myod1P10085 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Myod1P10085 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Myod1P10085 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Myod1P10085 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Myod1P10085 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Myod1P10085 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Myod1P10085 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Myod1P10085 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Myod1P10085 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Myod1P10085 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Myod1P10085 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Myod1P10085 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Myod1P10085 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Myod1P10085 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Myod1P10085 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Myod1P10085 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Myod1P10085 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Myod1P10085 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Myod1P10085 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Myod1P10085 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Myod1P10085 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Myod1P10085 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Myod1P10085 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Myod1P10085 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Myod1P10085 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Myod1P10085 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Myod1P10085 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Myod1P10085 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Myod1P10085 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Myod1P10085 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Myod1P10085 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Myod1P10085 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Myod1P10085 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Myod1P10085 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Myod1P10085 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Myod1P10085 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Myod1P10085 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Myod1P10085 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Myod1P10085 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Myod1P10085 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Myod1P10085 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Myod1P10085 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Myod1P10085 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Myod1P10085 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Myod1P10085 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Myod1P10085 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Myod1P10085 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Myod1P10085 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Myod1P10085 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Myod1P10085 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Myod1P10085 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Myod1P10085 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Myod1P10085 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Myod1P10085 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Myod1P10085 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Myod1P10085 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Myod1P10085 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Myod1P10085 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Myod1P10085 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Myod1P10085 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Myod1P10085 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Myod1P10085 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Myod1P10085 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms