Protein–RNA interactions for Protein: P0DN91

Tmem254c, Transmembrane protein 254c, mousemouse

Predictions only

Length 123 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem254cP0DN91 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tmem254cP0DN91 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tmem254cP0DN91 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tmem254cP0DN91 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tmem254cP0DN91 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tmem254cP0DN91 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tmem254cP0DN91 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tmem254cP0DN91 Sox11-201ENSMUST00000079063 8311 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tmem254cP0DN91 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tmem254cP0DN91 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tmem254cP0DN91 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tmem254cP0DN91 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tmem254cP0DN91 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tmem254cP0DN91 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tmem254cP0DN91 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tmem254cP0DN91 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tmem254cP0DN91 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tmem254cP0DN91 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tmem254cP0DN91 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tmem254cP0DN91 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Tmem254cP0DN91 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tmem254cP0DN91 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tmem254cP0DN91 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tmem254cP0DN91 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tmem254cP0DN91 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tmem254cP0DN91 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tmem254cP0DN91 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tmem254cP0DN91 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tmem254cP0DN91 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tmem254cP0DN91 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tmem254cP0DN91 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tmem254cP0DN91 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tmem254cP0DN91 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tmem254cP0DN91 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tmem254cP0DN91 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tmem254cP0DN91 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tmem254cP0DN91 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tmem254cP0DN91 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tmem254cP0DN91 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tmem254cP0DN91 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tmem254cP0DN91 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tmem254cP0DN91 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tmem254cP0DN91 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tmem254cP0DN91 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tmem254cP0DN91 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tmem254cP0DN91 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tmem254cP0DN91 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tmem254cP0DN91 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tmem254cP0DN91 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tmem254cP0DN91 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tmem254cP0DN91 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tmem254cP0DN91 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tmem254cP0DN91 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tmem254cP0DN91 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tmem254cP0DN91 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Tmem254cP0DN91 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tmem254cP0DN91 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tmem254cP0DN91 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tmem254cP0DN91 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tmem254cP0DN91 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tmem254cP0DN91 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Tmem254cP0DN91 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tmem254cP0DN91 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tmem254cP0DN91 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tmem254cP0DN91 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tmem254cP0DN91 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tmem254cP0DN91 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tmem254cP0DN91 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Tmem254cP0DN91 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Tmem254cP0DN91 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Tmem254cP0DN91 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Tmem254cP0DN91 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Tmem254cP0DN91 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Tmem254cP0DN91 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Tmem254cP0DN91 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Tmem254cP0DN91 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Tmem254cP0DN91 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Tmem254cP0DN91 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Tmem254cP0DN91 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Tmem254cP0DN91 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Tmem254cP0DN91 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Tmem254cP0DN91 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Tmem254cP0DN91 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Tmem254cP0DN91 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Tmem254cP0DN91 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Tmem254cP0DN91 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Tmem254cP0DN91 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Tmem254cP0DN91 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Tmem254cP0DN91 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Tmem254cP0DN91 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Tmem254cP0DN91 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Tmem254cP0DN91 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Tmem254cP0DN91 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Tmem254cP0DN91 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Tmem254cP0DN91 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Tmem254cP0DN91 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Tmem254cP0DN91 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Tmem254cP0DN91 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Tmem254cP0DN91 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Tmem254cP0DN91 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms