Protein–RNA interactions for Protein: P0DN90

Tmem254b, Transmembrane protein 254b, mousemouse

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Length 123 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem254bP0DN90 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tmem254bP0DN90 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tmem254bP0DN90 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tmem254bP0DN90 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tmem254bP0DN90 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tmem254bP0DN90 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tmem254bP0DN90 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tmem254bP0DN90 Sox11-201ENSMUST00000079063 8311 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tmem254bP0DN90 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tmem254bP0DN90 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tmem254bP0DN90 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tmem254bP0DN90 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tmem254bP0DN90 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tmem254bP0DN90 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tmem254bP0DN90 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tmem254bP0DN90 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tmem254bP0DN90 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tmem254bP0DN90 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tmem254bP0DN90 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tmem254bP0DN90 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Tmem254bP0DN90 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tmem254bP0DN90 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tmem254bP0DN90 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tmem254bP0DN90 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tmem254bP0DN90 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tmem254bP0DN90 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tmem254bP0DN90 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tmem254bP0DN90 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tmem254bP0DN90 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tmem254bP0DN90 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tmem254bP0DN90 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tmem254bP0DN90 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tmem254bP0DN90 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tmem254bP0DN90 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tmem254bP0DN90 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tmem254bP0DN90 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tmem254bP0DN90 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tmem254bP0DN90 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tmem254bP0DN90 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tmem254bP0DN90 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tmem254bP0DN90 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tmem254bP0DN90 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tmem254bP0DN90 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tmem254bP0DN90 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tmem254bP0DN90 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tmem254bP0DN90 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tmem254bP0DN90 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tmem254bP0DN90 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tmem254bP0DN90 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tmem254bP0DN90 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tmem254bP0DN90 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tmem254bP0DN90 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tmem254bP0DN90 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tmem254bP0DN90 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tmem254bP0DN90 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Tmem254bP0DN90 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tmem254bP0DN90 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tmem254bP0DN90 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tmem254bP0DN90 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tmem254bP0DN90 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tmem254bP0DN90 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Tmem254bP0DN90 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tmem254bP0DN90 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tmem254bP0DN90 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tmem254bP0DN90 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tmem254bP0DN90 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tmem254bP0DN90 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tmem254bP0DN90 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Tmem254bP0DN90 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Tmem254bP0DN90 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Tmem254bP0DN90 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Tmem254bP0DN90 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Tmem254bP0DN90 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Tmem254bP0DN90 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Tmem254bP0DN90 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Tmem254bP0DN90 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Tmem254bP0DN90 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Tmem254bP0DN90 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Tmem254bP0DN90 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Tmem254bP0DN90 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Tmem254bP0DN90 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Tmem254bP0DN90 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Tmem254bP0DN90 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Tmem254bP0DN90 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Tmem254bP0DN90 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Tmem254bP0DN90 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Tmem254bP0DN90 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Tmem254bP0DN90 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Tmem254bP0DN90 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Tmem254bP0DN90 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Tmem254bP0DN90 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Tmem254bP0DN90 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Tmem254bP0DN90 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Tmem254bP0DN90 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Tmem254bP0DN90 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Tmem254bP0DN90 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Tmem254bP0DN90 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Tmem254bP0DN90 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Tmem254bP0DN90 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Tmem254bP0DN90 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
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