Protein–RNA interactions for Protein: P0DMN7

Amd1, S-adenosylmethionine decarboxylase proenzyme 1, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Amd1P0DMN7 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Amd1P0DMN7 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Amd1P0DMN7 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Amd1P0DMN7 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Amd1P0DMN7 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Amd1P0DMN7 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Amd1P0DMN7 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Amd1P0DMN7 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Amd1P0DMN7 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Amd1P0DMN7 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Amd1P0DMN7 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Amd1P0DMN7 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Amd1P0DMN7 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Amd1P0DMN7 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Amd1P0DMN7 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Amd1P0DMN7 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Amd1P0DMN7 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Amd1P0DMN7 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Amd1P0DMN7 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Amd1P0DMN7 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Amd1P0DMN7 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Amd1P0DMN7 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Amd1P0DMN7 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Amd1P0DMN7 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Amd1P0DMN7 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Amd1P0DMN7 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Amd1P0DMN7 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Amd1P0DMN7 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Amd1P0DMN7 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Amd1P0DMN7 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Amd1P0DMN7 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Amd1P0DMN7 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Amd1P0DMN7 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Amd1P0DMN7 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Amd1P0DMN7 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Amd1P0DMN7 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Amd1P0DMN7 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Amd1P0DMN7 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Amd1P0DMN7 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Amd1P0DMN7 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Amd1P0DMN7 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Amd1P0DMN7 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Amd1P0DMN7 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Amd1P0DMN7 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Amd1P0DMN7 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Amd1P0DMN7 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Amd1P0DMN7 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Amd1P0DMN7 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Amd1P0DMN7 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Amd1P0DMN7 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Amd1P0DMN7 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Amd1P0DMN7 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Amd1P0DMN7 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Amd1P0DMN7 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Amd1P0DMN7 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Amd1P0DMN7 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Amd1P0DMN7 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Amd1P0DMN7 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Amd1P0DMN7 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Amd1P0DMN7 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Amd1P0DMN7 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Amd1P0DMN7 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Amd1P0DMN7 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Amd1P0DMN7 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Amd1P0DMN7 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Amd1P0DMN7 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Amd1P0DMN7 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Amd1P0DMN7 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Amd1P0DMN7 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Amd1P0DMN7 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Amd1P0DMN7 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Amd1P0DMN7 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Amd1P0DMN7 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Amd1P0DMN7 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Amd1P0DMN7 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Amd1P0DMN7 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Amd1P0DMN7 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Amd1P0DMN7 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Amd1P0DMN7 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Amd1P0DMN7 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Amd1P0DMN7 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Amd1P0DMN7 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Amd1P0DMN7 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Amd1P0DMN7 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Amd1P0DMN7 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Amd1P0DMN7 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Amd1P0DMN7 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Amd1P0DMN7 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Amd1P0DMN7 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Amd1P0DMN7 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Amd1P0DMN7 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Amd1P0DMN7 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Amd1P0DMN7 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Amd1P0DMN7 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Amd1P0DMN7 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Amd1P0DMN7 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Amd1P0DMN7 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Amd1P0DMN7 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Amd1P0DMN7 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Amd1P0DMN7 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms