Protein–RNA interactions for Protein: P0C5E4

Ptprq, Phosphatidylinositol phosphatase PTPRQ, mousemouse

Predictions only

Length 2,300 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprqP0C5E4 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
PtprqP0C5E4 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
PtprqP0C5E4 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
PtprqP0C5E4 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
PtprqP0C5E4 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
PtprqP0C5E4 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
PtprqP0C5E4 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
PtprqP0C5E4 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
PtprqP0C5E4 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
PtprqP0C5E4 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
PtprqP0C5E4 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
PtprqP0C5E4 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
PtprqP0C5E4 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
PtprqP0C5E4 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
PtprqP0C5E4 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
PtprqP0C5E4 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
PtprqP0C5E4 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
PtprqP0C5E4 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
PtprqP0C5E4 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
PtprqP0C5E4 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
PtprqP0C5E4 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
PtprqP0C5E4 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
PtprqP0C5E4 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
PtprqP0C5E4 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
PtprqP0C5E4 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.57□□□□□ -0.4
PtprqP0C5E4 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
PtprqP0C5E4 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
PtprqP0C5E4 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC12.57□□□□□ -0.4
PtprqP0C5E4 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.57□□□□□ -0.4
PtprqP0C5E4 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
PtprqP0C5E4 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
PtprqP0C5E4 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
PtprqP0C5E4 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
PtprqP0C5E4 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
PtprqP0C5E4 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
PtprqP0C5E4 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
PtprqP0C5E4 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
PtprqP0C5E4 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
PtprqP0C5E4 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
PtprqP0C5E4 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
PtprqP0C5E4 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
PtprqP0C5E4 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
PtprqP0C5E4 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
PtprqP0C5E4 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
PtprqP0C5E4 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
PtprqP0C5E4 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC12.57□□□□□ -0.4
PtprqP0C5E4 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
PtprqP0C5E4 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC12.57□□□□□ -0.4
PtprqP0C5E4 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
PtprqP0C5E4 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC12.57□□□□□ -0.4
PtprqP0C5E4 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC12.57□□□□□ -0.4
PtprqP0C5E4 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
PtprqP0C5E4 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
PtprqP0C5E4 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
PtprqP0C5E4 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
PtprqP0C5E4 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
PtprqP0C5E4 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
PtprqP0C5E4 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
PtprqP0C5E4 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
PtprqP0C5E4 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
PtprqP0C5E4 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
PtprqP0C5E4 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
PtprqP0C5E4 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
PtprqP0C5E4 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC12.56□□□□□ -0.4
PtprqP0C5E4 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC12.56□□□□□ -0.4
PtprqP0C5E4 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
PtprqP0C5E4 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
PtprqP0C5E4 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
PtprqP0C5E4 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
PtprqP0C5E4 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
PtprqP0C5E4 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
PtprqP0C5E4 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC12.56□□□□□ -0.4
PtprqP0C5E4 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
PtprqP0C5E4 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
PtprqP0C5E4 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
PtprqP0C5E4 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
PtprqP0C5E4 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
PtprqP0C5E4 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
PtprqP0C5E4 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
PtprqP0C5E4 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
PtprqP0C5E4 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
PtprqP0C5E4 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
PtprqP0C5E4 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
PtprqP0C5E4 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
PtprqP0C5E4 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
PtprqP0C5E4 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
PtprqP0C5E4 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
PtprqP0C5E4 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
PtprqP0C5E4 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
PtprqP0C5E4 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
PtprqP0C5E4 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
PtprqP0C5E4 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
PtprqP0C5E4 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
PtprqP0C5E4 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
PtprqP0C5E4 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
PtprqP0C5E4 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC12.55□□□□□ -0.4
PtprqP0C5E4 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
PtprqP0C5E4 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC12.55□□□□□ -0.4
PtprqP0C5E4 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
PtprqP0C5E4 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms