Protein–RNA interactions for Protein: P09632

Hoxb8, Homeobox protein Hox-B8, mousemouse

Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb8P09632 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hoxb8P09632 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hoxb8P09632 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hoxb8P09632 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hoxb8P09632 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hoxb8P09632 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Hoxb8P09632 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Hoxb8P09632 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Hoxb8P09632 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Hoxb8P09632 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Hoxb8P09632 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Hoxb8P09632 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Hoxb8P09632 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Hoxb8P09632 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Hoxb8P09632 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Hoxb8P09632 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Hoxb8P09632 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Hoxb8P09632 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Hoxb8P09632 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Hoxb8P09632 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Hoxb8P09632 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Hoxb8P09632 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Hoxb8P09632 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Hoxb8P09632 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Hoxb8P09632 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Hoxb8P09632 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Hoxb8P09632 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Hoxb8P09632 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Hoxb8P09632 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hoxb8P09632 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hoxb8P09632 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hoxb8P09632 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hoxb8P09632 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hoxb8P09632 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hoxb8P09632 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hoxb8P09632 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hoxb8P09632 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Hoxb8P09632 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hoxb8P09632 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hoxb8P09632 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hoxb8P09632 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hoxb8P09632 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hoxb8P09632 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hoxb8P09632 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hoxb8P09632 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hoxb8P09632 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Hoxb8P09632 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Hoxb8P09632 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Hoxb8P09632 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Hoxb8P09632 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Hoxb8P09632 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Hoxb8P09632 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Hoxb8P09632 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Hoxb8P09632 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Hoxb8P09632 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Hoxb8P09632 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Hoxb8P09632 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Hoxb8P09632 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Hoxb8P09632 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Hoxb8P09632 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Hoxb8P09632 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Hoxb8P09632 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hoxb8P09632 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hoxb8P09632 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hoxb8P09632 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hoxb8P09632 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hoxb8P09632 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hoxb8P09632 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hoxb8P09632 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Hoxb8P09632 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hoxb8P09632 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hoxb8P09632 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hoxb8P09632 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hoxb8P09632 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hoxb8P09632 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hoxb8P09632 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hoxb8P09632 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hoxb8P09632 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hoxb8P09632 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hoxb8P09632 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hoxb8P09632 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hoxb8P09632 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hoxb8P09632 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hoxb8P09632 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hoxb8P09632 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hoxb8P09632 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hoxb8P09632 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hoxb8P09632 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hoxb8P09632 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hoxb8P09632 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hoxb8P09632 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hoxb8P09632 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hoxb8P09632 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hoxb8P09632 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hoxb8P09632 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hoxb8P09632 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hoxb8P09632 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hoxb8P09632 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hoxb8P09632 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hoxb8P09632 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms