Protein–RNA interactions for Protein: P09024

Hoxb7, Homeobox protein Hox-B7, mousemouse

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb7P09024 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Hoxb7P09024 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Hoxb7P09024 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Hoxb7P09024 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Hoxb7P09024 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Hoxb7P09024 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Hoxb7P09024 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Hoxb7P09024 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Hoxb7P09024 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Hoxb7P09024 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Hoxb7P09024 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Hoxb7P09024 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Hoxb7P09024 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Hoxb7P09024 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Hoxb7P09024 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Hoxb7P09024 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Hoxb7P09024 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Hoxb7P09024 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Hoxb7P09024 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Hoxb7P09024 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Hoxb7P09024 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Hoxb7P09024 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Hoxb7P09024 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Hoxb7P09024 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Hoxb7P09024 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Hoxb7P09024 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Hoxb7P09024 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Hoxb7P09024 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Hoxb7P09024 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Hoxb7P09024 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Hoxb7P09024 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Hoxb7P09024 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Hoxb7P09024 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Hoxb7P09024 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Hoxb7P09024 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Hoxb7P09024 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Hoxb7P09024 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Hoxb7P09024 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Hoxb7P09024 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Hoxb7P09024 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Hoxb7P09024 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Hoxb7P09024 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Hoxb7P09024 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Hoxb7P09024 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Hoxb7P09024 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Hoxb7P09024 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Hoxb7P09024 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Hoxb7P09024 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Hoxb7P09024 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Hoxb7P09024 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Hoxb7P09024 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Hoxb7P09024 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Hoxb7P09024 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Hoxb7P09024 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Hoxb7P09024 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Hoxb7P09024 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Hoxb7P09024 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Hoxb7P09024 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Hoxb7P09024 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Hoxb7P09024 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Hoxb7P09024 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Hoxb7P09024 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Hoxb7P09024 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Hoxb7P09024 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Hoxb7P09024 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Hoxb7P09024 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Hoxb7P09024 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Hoxb7P09024 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Hoxb7P09024 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Hoxb7P09024 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Hoxb7P09024 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Hoxb7P09024 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Hoxb7P09024 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Hoxb7P09024 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Hoxb7P09024 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Hoxb7P09024 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Hoxb7P09024 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Hoxb7P09024 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Hoxb7P09024 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Hoxb7P09024 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Hoxb7P09024 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Hoxb7P09024 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Hoxb7P09024 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Hoxb7P09024 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Hoxb7P09024 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Hoxb7P09024 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
Hoxb7P09024 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Hoxb7P09024 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Hoxb7P09024 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Hoxb7P09024 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Hoxb7P09024 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Hoxb7P09024 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Hoxb7P09024 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Hoxb7P09024 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Hoxb7P09024 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Hoxb7P09024 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Hoxb7P09024 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Hoxb7P09024 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Hoxb7P09024 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Hoxb7P09024 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.6 ms