Protein–RNA interactions for Protein: P08032

Spta1, Spectrin alpha chain, erythrocytic 1, mousemouse

Predictions only

Length 2,415 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spta1P08032 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Spta1P08032 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Spta1P08032 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Spta1P08032 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Spta1P08032 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Spta1P08032 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Spta1P08032 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Spta1P08032 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Spta1P08032 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Spta1P08032 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Spta1P08032 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Spta1P08032 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Spta1P08032 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Spta1P08032 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Spta1P08032 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Spta1P08032 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Spta1P08032 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Spta1P08032 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Spta1P08032 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Spta1P08032 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Spta1P08032 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Spta1P08032 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Spta1P08032 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Spta1P08032 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Spta1P08032 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Spta1P08032 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Spta1P08032 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Spta1P08032 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Spta1P08032 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Spta1P08032 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Spta1P08032 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Spta1P08032 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Spta1P08032 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Spta1P08032 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Spta1P08032 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Spta1P08032 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Spta1P08032 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Spta1P08032 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Spta1P08032 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Spta1P08032 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Spta1P08032 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Spta1P08032 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Spta1P08032 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Spta1P08032 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Spta1P08032 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Spta1P08032 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Spta1P08032 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Spta1P08032 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Spta1P08032 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Spta1P08032 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Spta1P08032 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Spta1P08032 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Spta1P08032 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Spta1P08032 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Spta1P08032 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Spta1P08032 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Spta1P08032 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Spta1P08032 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Spta1P08032 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Spta1P08032 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Spta1P08032 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Spta1P08032 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Spta1P08032 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Spta1P08032 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Spta1P08032 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Spta1P08032 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Spta1P08032 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Spta1P08032 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Spta1P08032 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Spta1P08032 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Spta1P08032 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Spta1P08032 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Spta1P08032 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Spta1P08032 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Spta1P08032 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Spta1P08032 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Spta1P08032 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Spta1P08032 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Spta1P08032 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Spta1P08032 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Spta1P08032 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Spta1P08032 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Spta1P08032 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Spta1P08032 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Spta1P08032 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Spta1P08032 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Spta1P08032 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Spta1P08032 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Spta1P08032 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Spta1P08032 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Spta1P08032 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Spta1P08032 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Spta1P08032 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Spta1P08032 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Spta1P08032 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Spta1P08032 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Spta1P08032 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Spta1P08032 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Spta1P08032 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Spta1P08032 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms