Protein–RNA interactions for Protein: P07141

Csf1, Macrophage colony-stimulating factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csf1P07141 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Csf1P07141 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Csf1P07141 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Csf1P07141 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Csf1P07141 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Csf1P07141 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Csf1P07141 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Csf1P07141 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Csf1P07141 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Csf1P07141 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Csf1P07141 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Csf1P07141 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Csf1P07141 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Csf1P07141 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Csf1P07141 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Csf1P07141 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Csf1P07141 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Csf1P07141 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Csf1P07141 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Csf1P07141 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Csf1P07141 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Csf1P07141 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Csf1P07141 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Csf1P07141 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Csf1P07141 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Csf1P07141 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Csf1P07141 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Csf1P07141 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Csf1P07141 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Csf1P07141 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Csf1P07141 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Csf1P07141 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Csf1P07141 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Csf1P07141 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Csf1P07141 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Csf1P07141 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Csf1P07141 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Csf1P07141 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Csf1P07141 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Csf1P07141 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Csf1P07141 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Csf1P07141 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Csf1P07141 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Csf1P07141 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Csf1P07141 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Csf1P07141 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Csf1P07141 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Csf1P07141 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Csf1P07141 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Csf1P07141 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Csf1P07141 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Csf1P07141 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Csf1P07141 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Csf1P07141 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Csf1P07141 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Csf1P07141 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Csf1P07141 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Csf1P07141 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Csf1P07141 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Csf1P07141 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Csf1P07141 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Csf1P07141 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Csf1P07141 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Csf1P07141 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Csf1P07141 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Csf1P07141 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Csf1P07141 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Csf1P07141 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Csf1P07141 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Csf1P07141 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Csf1P07141 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Csf1P07141 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Csf1P07141 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Csf1P07141 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Csf1P07141 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Csf1P07141 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Csf1P07141 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Csf1P07141 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Csf1P07141 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Csf1P07141 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Csf1P07141 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Csf1P07141 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Csf1P07141 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Csf1P07141 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Csf1P07141 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Csf1P07141 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Csf1P07141 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Csf1P07141 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Csf1P07141 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Csf1P07141 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Csf1P07141 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Csf1P07141 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Csf1P07141 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Csf1P07141 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Csf1P07141 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Csf1P07141 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Csf1P07141 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Csf1P07141 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Csf1P07141 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Csf1P07141 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms