Protein–RNA interactions for Protein: P06798

Hoxa4, Homeobox protein Hox-A4, mousemouse

Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa4P06798 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Hoxa4P06798 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Hoxa4P06798 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Hoxa4P06798 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Hoxa4P06798 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Hoxa4P06798 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Hoxa4P06798 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Hoxa4P06798 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hoxa4P06798 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hoxa4P06798 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hoxa4P06798 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hoxa4P06798 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hoxa4P06798 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hoxa4P06798 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hoxa4P06798 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hoxa4P06798 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Hoxa4P06798 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hoxa4P06798 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Hoxa4P06798 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Hoxa4P06798 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hoxa4P06798 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hoxa4P06798 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Hoxa4P06798 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hoxa4P06798 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Hoxa4P06798 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hoxa4P06798 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hoxa4P06798 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hoxa4P06798 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hoxa4P06798 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hoxa4P06798 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hoxa4P06798 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hoxa4P06798 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hoxa4P06798 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hoxa4P06798 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Hoxa4P06798 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hoxa4P06798 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hoxa4P06798 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hoxa4P06798 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hoxa4P06798 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hoxa4P06798 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hoxa4P06798 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hoxa4P06798 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hoxa4P06798 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hoxa4P06798 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hoxa4P06798 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hoxa4P06798 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hoxa4P06798 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hoxa4P06798 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hoxa4P06798 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hoxa4P06798 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hoxa4P06798 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hoxa4P06798 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hoxa4P06798 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hoxa4P06798 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hoxa4P06798 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hoxa4P06798 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hoxa4P06798 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hoxa4P06798 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Hoxa4P06798 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hoxa4P06798 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hoxa4P06798 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hoxa4P06798 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hoxa4P06798 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hoxa4P06798 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hoxa4P06798 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hoxa4P06798 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hoxa4P06798 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hoxa4P06798 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Hoxa4P06798 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hoxa4P06798 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hoxa4P06798 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hoxa4P06798 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hoxa4P06798 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hoxa4P06798 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hoxa4P06798 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hoxa4P06798 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hoxa4P06798 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hoxa4P06798 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hoxa4P06798 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hoxa4P06798 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hoxa4P06798 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hoxa4P06798 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hoxa4P06798 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hoxa4P06798 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hoxa4P06798 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Hoxa4P06798 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hoxa4P06798 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hoxa4P06798 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hoxa4P06798 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hoxa4P06798 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hoxa4P06798 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hoxa4P06798 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hoxa4P06798 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hoxa4P06798 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hoxa4P06798 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hoxa4P06798 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hoxa4P06798 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hoxa4P06798 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hoxa4P06798 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hoxa4P06798 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40 ms