Protein–RNA interactions for Protein: P06344

H-2 class II histocompatibility antigen, A-U beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P06344 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
P06344 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
P06344 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P06344 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P06344 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
P06344 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P06344 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P06344 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P06344 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
P06344 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P06344 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P06344 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P06344 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P06344 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
P06344 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P06344 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P06344 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P06344 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
P06344 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
P06344 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
P06344 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P06344 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC15.06■□□□□ 0
P06344 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC15.06■□□□□ 0
P06344 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC15.06■□□□□ 0
P06344 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
P06344 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
P06344 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P06344 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P06344 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P06344 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
P06344 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P06344 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
P06344 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P06344 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P06344 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P06344 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P06344 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P06344 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
P06344 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
P06344 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
P06344 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
P06344 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
P06344 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
P06344 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
P06344 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC15.05■□□□□ -0
P06344 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
P06344 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
P06344 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
P06344 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
P06344 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
P06344 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
P06344 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
P06344 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
P06344 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
P06344 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
P06344 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
P06344 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
P06344 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
P06344 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
P06344 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
P06344 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
P06344 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
P06344 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
P06344 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P06344 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
P06344 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P06344 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P06344 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
P06344 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
P06344 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P06344 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P06344 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P06344 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC15.04■□□□□ -0
P06344 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
P06344 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
P06344 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
P06344 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC15.04■□□□□ -0
P06344 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P06344 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
P06344 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P06344 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P06344 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
P06344 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P06344 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P06344 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P06344 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P06344 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
P06344 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P06344 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P06344 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
P06344 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
P06344 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
P06344 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
P06344 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC15.03■□□□□ -0
P06344 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
P06344 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC15.03■□□□□ -0
P06344 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
P06344 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
P06344 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
P06344 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.9 ms