Protein–RNA interactions for Protein: P02468

Lamc1, Laminin subunit gamma-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,607 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lamc1P02468 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Lamc1P02468 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Lamc1P02468 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Lamc1P02468 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Lamc1P02468 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Lamc1P02468 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Lamc1P02468 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Lamc1P02468 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Lamc1P02468 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Lamc1P02468 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Lamc1P02468 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Lamc1P02468 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Lamc1P02468 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Lamc1P02468 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Lamc1P02468 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Lamc1P02468 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Lamc1P02468 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Lamc1P02468 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Lamc1P02468 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Lamc1P02468 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Lamc1P02468 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Lamc1P02468 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Lamc1P02468 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Lamc1P02468 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Lamc1P02468 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Lamc1P02468 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Lamc1P02468 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Lamc1P02468 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Lamc1P02468 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Lamc1P02468 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Lamc1P02468 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Lamc1P02468 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Lamc1P02468 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Lamc1P02468 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Lamc1P02468 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Lamc1P02468 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Lamc1P02468 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Lamc1P02468 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Lamc1P02468 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Lamc1P02468 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Lamc1P02468 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Lamc1P02468 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Lamc1P02468 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Lamc1P02468 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Lamc1P02468 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Lamc1P02468 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Lamc1P02468 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Lamc1P02468 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Lamc1P02468 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Lamc1P02468 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Lamc1P02468 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Lamc1P02468 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Lamc1P02468 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Lamc1P02468 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Lamc1P02468 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Lamc1P02468 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Lamc1P02468 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Lamc1P02468 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Lamc1P02468 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Lamc1P02468 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Lamc1P02468 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Lamc1P02468 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Lamc1P02468 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Lamc1P02468 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Lamc1P02468 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Lamc1P02468 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Lamc1P02468 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Lamc1P02468 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Lamc1P02468 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Lamc1P02468 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Lamc1P02468 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Lamc1P02468 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Lamc1P02468 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Lamc1P02468 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Lamc1P02468 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Lamc1P02468 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Lamc1P02468 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Lamc1P02468 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Lamc1P02468 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Lamc1P02468 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Lamc1P02468 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Lamc1P02468 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Lamc1P02468 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Lamc1P02468 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Lamc1P02468 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Lamc1P02468 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Lamc1P02468 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Lamc1P02468 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Lamc1P02468 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Lamc1P02468 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Lamc1P02468 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Lamc1P02468 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Lamc1P02468 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
Lamc1P02468 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Lamc1P02468 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Lamc1P02468 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Lamc1P02468 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
Lamc1P02468 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Lamc1P02468 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
Lamc1P02468 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms