Protein–RNA interactions for Protein: P01823

Ig heavy chain V region 36-60, mousemouse

Predictions only

Length 113 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01823 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
P01823 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
P01823 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
P01823 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
P01823 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
P01823 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
P01823 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
P01823 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
P01823 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
P01823 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
P01823 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
P01823 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
P01823 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
P01823 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
P01823 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
P01823 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
P01823 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
P01823 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
P01823 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
P01823 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
P01823 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
P01823 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
P01823 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
P01823 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
P01823 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
P01823 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
P01823 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
P01823 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
P01823 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
P01823 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
P01823 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
P01823 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
P01823 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
P01823 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
P01823 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
P01823 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
P01823 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
P01823 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
P01823 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
P01823 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
P01823 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
P01823 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
P01823 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
P01823 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
P01823 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
P01823 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
P01823 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
P01823 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
P01823 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
P01823 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
P01823 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
P01823 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
P01823 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
P01823 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
P01823 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
P01823 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
P01823 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
P01823 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
P01823 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
P01823 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
P01823 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
P01823 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
P01823 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
P01823 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
P01823 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
P01823 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
P01823 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
P01823 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.55
P01823 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01823 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01823 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01823 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01823 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01823 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01823 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
P01823 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
P01823 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01823 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
P01823 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01823 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01823 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01823 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01823 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01823 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01823 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01823 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01823 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01823 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
P01823 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01823 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01823 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01823 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01823 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01823 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01823 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01823 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01823 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01823 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01823 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01823 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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