Protein–RNA interactions for Protein: P01734

T-cell receptor beta chain V region 3H.25, mousemouse

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01734 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
P01734 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
P01734 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
P01734 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
P01734 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
P01734 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
P01734 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
P01734 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
P01734 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
P01734 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
P01734 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
P01734 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
P01734 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
P01734 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
P01734 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
P01734 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
P01734 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
P01734 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
P01734 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
P01734 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
P01734 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
P01734 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
P01734 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
P01734 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
P01734 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
P01734 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
P01734 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
P01734 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
P01734 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
P01734 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
P01734 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
P01734 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
P01734 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
P01734 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
P01734 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
P01734 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
P01734 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
P01734 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
P01734 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
P01734 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
P01734 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
P01734 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
P01734 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
P01734 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
P01734 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
P01734 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
P01734 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
P01734 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
P01734 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
P01734 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
P01734 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
P01734 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
P01734 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
P01734 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
P01734 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
P01734 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
P01734 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
P01734 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
P01734 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
P01734 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
P01734 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
P01734 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
P01734 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
P01734 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
P01734 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
P01734 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
P01734 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
P01734 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
P01734 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
P01734 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
P01734 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
P01734 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
P01734 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
P01734 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
P01734 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
P01734 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
P01734 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
P01734 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
P01734 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
P01734 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
P01734 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
P01734 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
P01734 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
P01734 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
P01734 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
P01734 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
P01734 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
P01734 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
P01734 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
P01734 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
P01734 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
P01734 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
P01734 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
P01734 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
P01734 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
P01734 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
P01734 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
P01734 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
P01734 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
P01734 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms