Protein–RNA interactions for Protein: P01665

Ig kappa chain V-III region PC 7043, mousemouse

Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01665 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
P01665 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
P01665 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
P01665 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
P01665 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
P01665 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
P01665 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
P01665 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
P01665 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
P01665 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
P01665 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
P01665 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
P01665 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
P01665 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
P01665 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
P01665 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
P01665 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
P01665 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
P01665 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
P01665 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
P01665 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
P01665 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
P01665 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
P01665 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
P01665 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
P01665 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
P01665 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
P01665 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
P01665 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
P01665 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
P01665 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
P01665 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
P01665 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
P01665 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
P01665 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
P01665 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
P01665 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
P01665 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
P01665 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
P01665 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
P01665 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
P01665 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
P01665 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
P01665 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
P01665 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
P01665 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
P01665 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
P01665 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
P01665 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
P01665 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P01665 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P01665 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P01665 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P01665 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P01665 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P01665 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P01665 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P01665 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P01665 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P01665 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
P01665 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P01665 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P01665 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
P01665 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
P01665 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
P01665 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P01665 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
P01665 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P01665 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P01665 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P01665 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P01665 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P01665 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P01665 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P01665 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
P01665 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P01665 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P01665 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
P01665 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P01665 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01665 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01665 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01665 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01665 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01665 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01665 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01665 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01665 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01665 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01665 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01665 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01665 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01665 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01665 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01665 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01665 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01665 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01665 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01665 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01665 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms