Protein–RNA interactions for Protein: O89110

Casp8, Caspase-8, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casp8O89110 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Casp8O89110 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Casp8O89110 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Casp8O89110 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Casp8O89110 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Casp8O89110 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Casp8O89110 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Casp8O89110 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Casp8O89110 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Casp8O89110 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Casp8O89110 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Casp8O89110 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Casp8O89110 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Casp8O89110 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Casp8O89110 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Casp8O89110 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Casp8O89110 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Casp8O89110 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Casp8O89110 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Casp8O89110 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Casp8O89110 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Casp8O89110 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Casp8O89110 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Casp8O89110 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Casp8O89110 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Casp8O89110 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Casp8O89110 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Casp8O89110 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Casp8O89110 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Casp8O89110 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Casp8O89110 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Casp8O89110 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Casp8O89110 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Casp8O89110 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Casp8O89110 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Casp8O89110 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Casp8O89110 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Casp8O89110 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Casp8O89110 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Casp8O89110 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Casp8O89110 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Casp8O89110 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Casp8O89110 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Casp8O89110 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Casp8O89110 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Casp8O89110 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Casp8O89110 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Casp8O89110 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Casp8O89110 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Casp8O89110 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Casp8O89110 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Casp8O89110 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Casp8O89110 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Casp8O89110 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Casp8O89110 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Casp8O89110 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Casp8O89110 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Casp8O89110 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Casp8O89110 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Casp8O89110 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Casp8O89110 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Casp8O89110 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Casp8O89110 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Casp8O89110 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Casp8O89110 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Casp8O89110 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Casp8O89110 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Casp8O89110 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Casp8O89110 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Casp8O89110 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Casp8O89110 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Casp8O89110 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Casp8O89110 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Casp8O89110 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Casp8O89110 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Casp8O89110 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Casp8O89110 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Casp8O89110 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Casp8O89110 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Casp8O89110 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Casp8O89110 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Casp8O89110 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Casp8O89110 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Casp8O89110 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Casp8O89110 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Casp8O89110 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Casp8O89110 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Casp8O89110 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Casp8O89110 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Casp8O89110 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Casp8O89110 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Casp8O89110 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Casp8O89110 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Casp8O89110 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Casp8O89110 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Casp8O89110 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Casp8O89110 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Casp8O89110 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Casp8O89110 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Casp8O89110 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms