Protein–RNA interactions for Protein: O88940

Msc, Musculin, mousemouse

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MscO88940 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MscO88940 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MscO88940 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MscO88940 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
MscO88940 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
MscO88940 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
MscO88940 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MscO88940 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
MscO88940 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
MscO88940 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
MscO88940 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MscO88940 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MscO88940 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MscO88940 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
MscO88940 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
MscO88940 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MscO88940 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
MscO88940 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MscO88940 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MscO88940 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MscO88940 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MscO88940 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
MscO88940 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MscO88940 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
MscO88940 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
MscO88940 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
MscO88940 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
MscO88940 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
MscO88940 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MscO88940 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MscO88940 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MscO88940 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MscO88940 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MscO88940 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MscO88940 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MscO88940 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MscO88940 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MscO88940 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
MscO88940 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
MscO88940 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
MscO88940 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
MscO88940 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
MscO88940 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
MscO88940 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
MscO88940 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
MscO88940 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
MscO88940 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
MscO88940 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
MscO88940 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
MscO88940 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
MscO88940 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
MscO88940 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
MscO88940 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
MscO88940 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
MscO88940 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
MscO88940 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
MscO88940 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
MscO88940 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
MscO88940 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
MscO88940 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
MscO88940 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
MscO88940 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
MscO88940 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
MscO88940 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MscO88940 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MscO88940 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MscO88940 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MscO88940 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MscO88940 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MscO88940 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MscO88940 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
MscO88940 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MscO88940 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MscO88940 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MscO88940 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MscO88940 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MscO88940 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MscO88940 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MscO88940 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MscO88940 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
MscO88940 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MscO88940 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MscO88940 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MscO88940 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MscO88940 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MscO88940 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MscO88940 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MscO88940 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MscO88940 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MscO88940 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MscO88940 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MscO88940 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MscO88940 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MscO88940 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
MscO88940 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MscO88940 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MscO88940 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MscO88940 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MscO88940 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MscO88940 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.9 ms