Protein–RNA interactions for Protein: O88609

Lmx1b, LIM homeobox transcription factor 1-beta, mousemouse

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmx1bO88609 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lmx1bO88609 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lmx1bO88609 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lmx1bO88609 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lmx1bO88609 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lmx1bO88609 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lmx1bO88609 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lmx1bO88609 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lmx1bO88609 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lmx1bO88609 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lmx1bO88609 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lmx1bO88609 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lmx1bO88609 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lmx1bO88609 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lmx1bO88609 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lmx1bO88609 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lmx1bO88609 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lmx1bO88609 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lmx1bO88609 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lmx1bO88609 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lmx1bO88609 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lmx1bO88609 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lmx1bO88609 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lmx1bO88609 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Lmx1bO88609 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lmx1bO88609 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Lmx1bO88609 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lmx1bO88609 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Lmx1bO88609 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Lmx1bO88609 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lmx1bO88609 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lmx1bO88609 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Lmx1bO88609 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lmx1bO88609 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lmx1bO88609 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lmx1bO88609 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lmx1bO88609 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lmx1bO88609 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lmx1bO88609 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lmx1bO88609 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lmx1bO88609 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lmx1bO88609 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lmx1bO88609 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lmx1bO88609 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lmx1bO88609 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lmx1bO88609 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lmx1bO88609 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lmx1bO88609 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lmx1bO88609 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Lmx1bO88609 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lmx1bO88609 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lmx1bO88609 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lmx1bO88609 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Lmx1bO88609 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lmx1bO88609 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lmx1bO88609 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lmx1bO88609 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lmx1bO88609 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lmx1bO88609 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lmx1bO88609 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lmx1bO88609 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lmx1bO88609 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lmx1bO88609 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lmx1bO88609 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lmx1bO88609 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lmx1bO88609 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lmx1bO88609 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lmx1bO88609 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lmx1bO88609 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lmx1bO88609 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lmx1bO88609 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lmx1bO88609 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lmx1bO88609 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lmx1bO88609 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lmx1bO88609 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lmx1bO88609 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lmx1bO88609 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lmx1bO88609 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lmx1bO88609 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lmx1bO88609 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lmx1bO88609 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Lmx1bO88609 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lmx1bO88609 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lmx1bO88609 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lmx1bO88609 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lmx1bO88609 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lmx1bO88609 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lmx1bO88609 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lmx1bO88609 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lmx1bO88609 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lmx1bO88609 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lmx1bO88609 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lmx1bO88609 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lmx1bO88609 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lmx1bO88609 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lmx1bO88609 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lmx1bO88609 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lmx1bO88609 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lmx1bO88609 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lmx1bO88609 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms