Protein–RNA interactions for Protein: O88456

Capns1, Calpain small subunit 1, mousemouse

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Length 269 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capns1O88456 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Capns1O88456 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Capns1O88456 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Capns1O88456 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Capns1O88456 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Capns1O88456 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Capns1O88456 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Capns1O88456 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Capns1O88456 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Capns1O88456 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Capns1O88456 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Capns1O88456 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
Capns1O88456 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Capns1O88456 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Capns1O88456 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Capns1O88456 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Capns1O88456 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Capns1O88456 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Capns1O88456 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Capns1O88456 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Capns1O88456 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Capns1O88456 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Capns1O88456 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Capns1O88456 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Capns1O88456 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Capns1O88456 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Capns1O88456 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Capns1O88456 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Capns1O88456 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Capns1O88456 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Capns1O88456 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Capns1O88456 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Capns1O88456 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Capns1O88456 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Capns1O88456 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Capns1O88456 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Capns1O88456 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Capns1O88456 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Capns1O88456 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Capns1O88456 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Capns1O88456 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Capns1O88456 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Capns1O88456 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Capns1O88456 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Capns1O88456 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Capns1O88456 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Capns1O88456 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Capns1O88456 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Capns1O88456 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Capns1O88456 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Capns1O88456 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Capns1O88456 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Capns1O88456 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Capns1O88456 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Capns1O88456 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Capns1O88456 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Capns1O88456 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Capns1O88456 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Capns1O88456 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Capns1O88456 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Capns1O88456 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Capns1O88456 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Capns1O88456 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Capns1O88456 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Capns1O88456 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Capns1O88456 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Capns1O88456 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Capns1O88456 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Capns1O88456 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Capns1O88456 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Capns1O88456 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Capns1O88456 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Capns1O88456 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Capns1O88456 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Capns1O88456 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Capns1O88456 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Capns1O88456 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Capns1O88456 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Capns1O88456 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Capns1O88456 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Capns1O88456 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Capns1O88456 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Capns1O88456 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Capns1O88456 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Capns1O88456 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Capns1O88456 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Capns1O88456 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Capns1O88456 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Capns1O88456 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Capns1O88456 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Capns1O88456 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Capns1O88456 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Capns1O88456 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Capns1O88456 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Capns1O88456 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Capns1O88456 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Capns1O88456 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Capns1O88456 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Capns1O88456 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Capns1O88456 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms