Protein–RNA interactions for Protein: O88384

Vti1b, Vesicle transport through interaction with t-SNAREs homolog 1B, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vti1bO88384 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vti1bO88384 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vti1bO88384 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vti1bO88384 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vti1bO88384 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Vti1bO88384 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vti1bO88384 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vti1bO88384 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vti1bO88384 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vti1bO88384 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vti1bO88384 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vti1bO88384 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vti1bO88384 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vti1bO88384 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vti1bO88384 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vti1bO88384 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vti1bO88384 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vti1bO88384 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vti1bO88384 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vti1bO88384 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vti1bO88384 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vti1bO88384 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vti1bO88384 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vti1bO88384 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vti1bO88384 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vti1bO88384 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vti1bO88384 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Vti1bO88384 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vti1bO88384 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Vti1bO88384 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vti1bO88384 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vti1bO88384 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Vti1bO88384 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vti1bO88384 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Vti1bO88384 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vti1bO88384 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Vti1bO88384 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Vti1bO88384 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vti1bO88384 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vti1bO88384 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vti1bO88384 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vti1bO88384 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vti1bO88384 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vti1bO88384 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vti1bO88384 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vti1bO88384 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vti1bO88384 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vti1bO88384 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vti1bO88384 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vti1bO88384 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Vti1bO88384 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vti1bO88384 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vti1bO88384 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Vti1bO88384 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vti1bO88384 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vti1bO88384 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vti1bO88384 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vti1bO88384 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vti1bO88384 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vti1bO88384 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vti1bO88384 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vti1bO88384 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vti1bO88384 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vti1bO88384 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vti1bO88384 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vti1bO88384 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vti1bO88384 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vti1bO88384 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Vti1bO88384 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vti1bO88384 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vti1bO88384 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vti1bO88384 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vti1bO88384 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vti1bO88384 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vti1bO88384 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vti1bO88384 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vti1bO88384 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vti1bO88384 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vti1bO88384 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vti1bO88384 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vti1bO88384 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vti1bO88384 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vti1bO88384 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vti1bO88384 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vti1bO88384 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vti1bO88384 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vti1bO88384 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vti1bO88384 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vti1bO88384 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vti1bO88384 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vti1bO88384 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vti1bO88384 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vti1bO88384 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vti1bO88384 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vti1bO88384 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vti1bO88384 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vti1bO88384 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vti1bO88384 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vti1bO88384 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vti1bO88384 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.1 ms