Protein–RNA interactions for Protein: O88327

Ctnnal1, Alpha-catulin, mousemouse

Predictions only

Length 731 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnnal1O88327 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ctnnal1O88327 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ctnnal1O88327 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ctnnal1O88327 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ctnnal1O88327 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ctnnal1O88327 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ctnnal1O88327 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ctnnal1O88327 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ctnnal1O88327 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ctnnal1O88327 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ctnnal1O88327 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ctnnal1O88327 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ctnnal1O88327 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ctnnal1O88327 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ctnnal1O88327 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ctnnal1O88327 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ctnnal1O88327 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ctnnal1O88327 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ctnnal1O88327 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Ctnnal1O88327 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ctnnal1O88327 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ctnnal1O88327 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ctnnal1O88327 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ctnnal1O88327 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ctnnal1O88327 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ctnnal1O88327 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ctnnal1O88327 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ctnnal1O88327 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ctnnal1O88327 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ctnnal1O88327 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ctnnal1O88327 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ctnnal1O88327 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ctnnal1O88327 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ctnnal1O88327 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Ctnnal1O88327 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ctnnal1O88327 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ctnnal1O88327 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ctnnal1O88327 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Ctnnal1O88327 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ctnnal1O88327 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ctnnal1O88327 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ctnnal1O88327 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ctnnal1O88327 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ctnnal1O88327 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ctnnal1O88327 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ctnnal1O88327 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ctnnal1O88327 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ctnnal1O88327 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ctnnal1O88327 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ctnnal1O88327 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ctnnal1O88327 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ctnnal1O88327 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ctnnal1O88327 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ctnnal1O88327 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ctnnal1O88327 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ctnnal1O88327 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ctnnal1O88327 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ctnnal1O88327 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ctnnal1O88327 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ctnnal1O88327 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ctnnal1O88327 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ctnnal1O88327 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ctnnal1O88327 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ctnnal1O88327 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ctnnal1O88327 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ctnnal1O88327 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ctnnal1O88327 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ctnnal1O88327 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ctnnal1O88327 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ctnnal1O88327 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Ctnnal1O88327 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Ctnnal1O88327 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ctnnal1O88327 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ctnnal1O88327 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ctnnal1O88327 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ctnnal1O88327 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ctnnal1O88327 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ctnnal1O88327 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ctnnal1O88327 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ctnnal1O88327 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ctnnal1O88327 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ctnnal1O88327 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ctnnal1O88327 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ctnnal1O88327 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ctnnal1O88327 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ctnnal1O88327 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Ctnnal1O88327 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Ctnnal1O88327 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ctnnal1O88327 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ctnnal1O88327 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ctnnal1O88327 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Ctnnal1O88327 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ctnnal1O88327 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ctnnal1O88327 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ctnnal1O88327 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ctnnal1O88327 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ctnnal1O88327 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ctnnal1O88327 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ctnnal1O88327 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ctnnal1O88327 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.1 ms