Protein–RNA interactions for Protein: O70370

Ctss, Cathepsin S, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtssO70370 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CtssO70370 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
CtssO70370 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CtssO70370 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CtssO70370 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
CtssO70370 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CtssO70370 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CtssO70370 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CtssO70370 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CtssO70370 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CtssO70370 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CtssO70370 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CtssO70370 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CtssO70370 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CtssO70370 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CtssO70370 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CtssO70370 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CtssO70370 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CtssO70370 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CtssO70370 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CtssO70370 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CtssO70370 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CtssO70370 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CtssO70370 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CtssO70370 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CtssO70370 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CtssO70370 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CtssO70370 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CtssO70370 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CtssO70370 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CtssO70370 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CtssO70370 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CtssO70370 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CtssO70370 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CtssO70370 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CtssO70370 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CtssO70370 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CtssO70370 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CtssO70370 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CtssO70370 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CtssO70370 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CtssO70370 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CtssO70370 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CtssO70370 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CtssO70370 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CtssO70370 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CtssO70370 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CtssO70370 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CtssO70370 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CtssO70370 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CtssO70370 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CtssO70370 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CtssO70370 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CtssO70370 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CtssO70370 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CtssO70370 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CtssO70370 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CtssO70370 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CtssO70370 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CtssO70370 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CtssO70370 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CtssO70370 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CtssO70370 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CtssO70370 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CtssO70370 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CtssO70370 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CtssO70370 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CtssO70370 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CtssO70370 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CtssO70370 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CtssO70370 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CtssO70370 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CtssO70370 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CtssO70370 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CtssO70370 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CtssO70370 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CtssO70370 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
CtssO70370 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CtssO70370 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CtssO70370 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CtssO70370 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CtssO70370 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CtssO70370 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CtssO70370 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CtssO70370 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CtssO70370 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CtssO70370 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CtssO70370 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CtssO70370 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
CtssO70370 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CtssO70370 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CtssO70370 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CtssO70370 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CtssO70370 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CtssO70370 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CtssO70370 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
CtssO70370 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
CtssO70370 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
CtssO70370 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
CtssO70370 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms