Protein–RNA interactions for Protein: O70174

Chrna4, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 629 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chrna4O70174 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Chrna4O70174 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Chrna4O70174 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Chrna4O70174 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Chrna4O70174 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Chrna4O70174 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Chrna4O70174 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Chrna4O70174 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Chrna4O70174 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Chrna4O70174 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Chrna4O70174 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Chrna4O70174 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Chrna4O70174 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Chrna4O70174 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Chrna4O70174 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Chrna4O70174 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Chrna4O70174 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Chrna4O70174 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Chrna4O70174 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Chrna4O70174 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Chrna4O70174 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Chrna4O70174 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Chrna4O70174 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Chrna4O70174 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Chrna4O70174 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Chrna4O70174 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Chrna4O70174 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Chrna4O70174 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Chrna4O70174 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Chrna4O70174 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Chrna4O70174 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Chrna4O70174 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Chrna4O70174 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Chrna4O70174 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Chrna4O70174 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Chrna4O70174 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Chrna4O70174 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Chrna4O70174 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Chrna4O70174 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Chrna4O70174 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Chrna4O70174 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Chrna4O70174 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Chrna4O70174 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Chrna4O70174 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Chrna4O70174 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Chrna4O70174 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Chrna4O70174 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Chrna4O70174 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Chrna4O70174 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Chrna4O70174 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Chrna4O70174 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Chrna4O70174 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Chrna4O70174 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Chrna4O70174 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Chrna4O70174 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Chrna4O70174 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Chrna4O70174 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Chrna4O70174 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Chrna4O70174 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Chrna4O70174 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Chrna4O70174 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Chrna4O70174 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Chrna4O70174 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Chrna4O70174 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Chrna4O70174 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Chrna4O70174 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Chrna4O70174 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Chrna4O70174 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Chrna4O70174 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Chrna4O70174 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Chrna4O70174 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Chrna4O70174 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Chrna4O70174 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Chrna4O70174 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Chrna4O70174 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Chrna4O70174 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Chrna4O70174 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Chrna4O70174 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Chrna4O70174 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Chrna4O70174 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Chrna4O70174 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Chrna4O70174 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Chrna4O70174 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Chrna4O70174 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Chrna4O70174 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Chrna4O70174 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Chrna4O70174 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Chrna4O70174 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Chrna4O70174 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Chrna4O70174 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Chrna4O70174 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Chrna4O70174 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Chrna4O70174 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Chrna4O70174 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Chrna4O70174 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Chrna4O70174 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Chrna4O70174 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Chrna4O70174 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Chrna4O70174 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Chrna4O70174 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms