Protein–RNA interactions for Protein: O55201

Supt5h, Transcription elongation factor SPT5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,082 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Supt5hO55201 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Supt5hO55201 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Supt5hO55201 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Supt5hO55201 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Supt5hO55201 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Supt5hO55201 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Supt5hO55201 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Supt5hO55201 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Supt5hO55201 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Supt5hO55201 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Supt5hO55201 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Supt5hO55201 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Supt5hO55201 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Supt5hO55201 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Supt5hO55201 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Supt5hO55201 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Supt5hO55201 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Supt5hO55201 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Supt5hO55201 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Supt5hO55201 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Supt5hO55201 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
Supt5hO55201 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Supt5hO55201 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Supt5hO55201 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Supt5hO55201 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Supt5hO55201 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Supt5hO55201 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Supt5hO55201 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Supt5hO55201 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Supt5hO55201 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Supt5hO55201 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Supt5hO55201 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Supt5hO55201 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Supt5hO55201 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Supt5hO55201 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Supt5hO55201 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Supt5hO55201 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Supt5hO55201 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Supt5hO55201 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Supt5hO55201 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Supt5hO55201 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Supt5hO55201 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Supt5hO55201 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Supt5hO55201 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Supt5hO55201 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Supt5hO55201 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Supt5hO55201 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Supt5hO55201 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Supt5hO55201 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Supt5hO55201 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Supt5hO55201 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Supt5hO55201 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Supt5hO55201 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Supt5hO55201 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Supt5hO55201 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Supt5hO55201 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Supt5hO55201 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Supt5hO55201 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Supt5hO55201 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Supt5hO55201 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Supt5hO55201 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Supt5hO55201 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Supt5hO55201 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Supt5hO55201 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Supt5hO55201 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Supt5hO55201 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Supt5hO55201 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Supt5hO55201 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Supt5hO55201 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Supt5hO55201 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Supt5hO55201 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Supt5hO55201 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Supt5hO55201 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Supt5hO55201 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Supt5hO55201 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Supt5hO55201 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Supt5hO55201 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Supt5hO55201 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Supt5hO55201 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Supt5hO55201 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Supt5hO55201 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Supt5hO55201 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Supt5hO55201 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Supt5hO55201 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Supt5hO55201 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Supt5hO55201 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Supt5hO55201 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Supt5hO55201 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Supt5hO55201 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Supt5hO55201 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Supt5hO55201 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Supt5hO55201 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Supt5hO55201 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Supt5hO55201 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Supt5hO55201 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Supt5hO55201 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Supt5hO55201 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Supt5hO55201 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Supt5hO55201 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Supt5hO55201 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.8 ms