Protein–RNA interactions for Protein: O55187

Cbx4, E3 SUMO-protein ligase CBX4, mousemouse

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cbx4O55187 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cbx4O55187 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cbx4O55187 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cbx4O55187 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cbx4O55187 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cbx4O55187 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cbx4O55187 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cbx4O55187 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cbx4O55187 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cbx4O55187 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cbx4O55187 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cbx4O55187 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cbx4O55187 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cbx4O55187 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cbx4O55187 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cbx4O55187 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cbx4O55187 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cbx4O55187 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cbx4O55187 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cbx4O55187 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cbx4O55187 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cbx4O55187 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cbx4O55187 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cbx4O55187 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cbx4O55187 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cbx4O55187 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cbx4O55187 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cbx4O55187 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cbx4O55187 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cbx4O55187 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cbx4O55187 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cbx4O55187 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Cbx4O55187 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cbx4O55187 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cbx4O55187 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cbx4O55187 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cbx4O55187 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cbx4O55187 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cbx4O55187 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cbx4O55187 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cbx4O55187 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Cbx4O55187 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cbx4O55187 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cbx4O55187 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cbx4O55187 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cbx4O55187 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cbx4O55187 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cbx4O55187 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cbx4O55187 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cbx4O55187 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cbx4O55187 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cbx4O55187 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cbx4O55187 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cbx4O55187 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cbx4O55187 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cbx4O55187 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cbx4O55187 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cbx4O55187 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cbx4O55187 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cbx4O55187 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cbx4O55187 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cbx4O55187 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cbx4O55187 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cbx4O55187 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cbx4O55187 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cbx4O55187 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cbx4O55187 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cbx4O55187 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cbx4O55187 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cbx4O55187 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cbx4O55187 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cbx4O55187 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cbx4O55187 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cbx4O55187 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cbx4O55187 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cbx4O55187 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cbx4O55187 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cbx4O55187 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cbx4O55187 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cbx4O55187 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cbx4O55187 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cbx4O55187 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cbx4O55187 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cbx4O55187 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cbx4O55187 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cbx4O55187 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cbx4O55187 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cbx4O55187 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cbx4O55187 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cbx4O55187 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cbx4O55187 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cbx4O55187 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Cbx4O55187 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cbx4O55187 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cbx4O55187 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cbx4O55187 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cbx4O55187 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cbx4O55187 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cbx4O55187 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Cbx4O55187 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms