Protein–RNA interactions for Protein: O55176

Pja1, E3 ubiquitin-protein ligase Praja-1, mousemouse

Predictions only

Length 578 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pja1O55176 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pja1O55176 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pja1O55176 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pja1O55176 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pja1O55176 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pja1O55176 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pja1O55176 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pja1O55176 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pja1O55176 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pja1O55176 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pja1O55176 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pja1O55176 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pja1O55176 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pja1O55176 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pja1O55176 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pja1O55176 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pja1O55176 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pja1O55176 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pja1O55176 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pja1O55176 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pja1O55176 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pja1O55176 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pja1O55176 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pja1O55176 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pja1O55176 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pja1O55176 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pja1O55176 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pja1O55176 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pja1O55176 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pja1O55176 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pja1O55176 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pja1O55176 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pja1O55176 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pja1O55176 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pja1O55176 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Pja1O55176 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Pja1O55176 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pja1O55176 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pja1O55176 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pja1O55176 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pja1O55176 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pja1O55176 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pja1O55176 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pja1O55176 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pja1O55176 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pja1O55176 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pja1O55176 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pja1O55176 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pja1O55176 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pja1O55176 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pja1O55176 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pja1O55176 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pja1O55176 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pja1O55176 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pja1O55176 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Pja1O55176 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pja1O55176 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pja1O55176 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pja1O55176 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pja1O55176 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pja1O55176 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Pja1O55176 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Pja1O55176 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pja1O55176 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pja1O55176 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pja1O55176 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pja1O55176 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pja1O55176 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pja1O55176 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pja1O55176 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pja1O55176 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pja1O55176 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pja1O55176 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pja1O55176 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Pja1O55176 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pja1O55176 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pja1O55176 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pja1O55176 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pja1O55176 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pja1O55176 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pja1O55176 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pja1O55176 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pja1O55176 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pja1O55176 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Pja1O55176 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Pja1O55176 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Pja1O55176 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Pja1O55176 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Pja1O55176 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Pja1O55176 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Pja1O55176 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Pja1O55176 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Pja1O55176 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Pja1O55176 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Pja1O55176 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Pja1O55176 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Pja1O55176 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Pja1O55176 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Pja1O55176 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Pja1O55176 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.3 ms