Protein–RNA interactions for Protein: O55144

Tlx3, T-cell leukemia homeobox protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 291 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlx3O55144 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tlx3O55144 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Tlx3O55144 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tlx3O55144 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tlx3O55144 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tlx3O55144 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tlx3O55144 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tlx3O55144 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tlx3O55144 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tlx3O55144 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tlx3O55144 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tlx3O55144 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tlx3O55144 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tlx3O55144 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tlx3O55144 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tlx3O55144 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tlx3O55144 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tlx3O55144 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tlx3O55144 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Tlx3O55144 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Tlx3O55144 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Tlx3O55144 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Tlx3O55144 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC16.21■□□□□ 0.18
Tlx3O55144 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tlx3O55144 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tlx3O55144 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tlx3O55144 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tlx3O55144 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tlx3O55144 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Tlx3O55144 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tlx3O55144 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tlx3O55144 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tlx3O55144 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tlx3O55144 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tlx3O55144 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tlx3O55144 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Tlx3O55144 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tlx3O55144 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Tlx3O55144 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tlx3O55144 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tlx3O55144 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tlx3O55144 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tlx3O55144 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tlx3O55144 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tlx3O55144 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tlx3O55144 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tlx3O55144 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tlx3O55144 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tlx3O55144 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tlx3O55144 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tlx3O55144 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tlx3O55144 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tlx3O55144 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tlx3O55144 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tlx3O55144 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tlx3O55144 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tlx3O55144 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tlx3O55144 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tlx3O55144 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tlx3O55144 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tlx3O55144 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tlx3O55144 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tlx3O55144 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tlx3O55144 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tlx3O55144 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tlx3O55144 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tlx3O55144 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tlx3O55144 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tlx3O55144 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tlx3O55144 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Tlx3O55144 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tlx3O55144 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tlx3O55144 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tlx3O55144 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tlx3O55144 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tlx3O55144 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tlx3O55144 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tlx3O55144 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tlx3O55144 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tlx3O55144 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tlx3O55144 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tlx3O55144 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tlx3O55144 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tlx3O55144 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tlx3O55144 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tlx3O55144 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Tlx3O55144 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tlx3O55144 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tlx3O55144 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tlx3O55144 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Tlx3O55144 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Tlx3O55144 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tlx3O55144 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tlx3O55144 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tlx3O55144 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tlx3O55144 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tlx3O55144 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tlx3O55144 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tlx3O55144 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tlx3O55144 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.1 ms