Protein–RNA interactions for Protein: O55143

Atp2a2, Sarcoplasmic/endoplasmic reticulum calcium ATPase 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,044 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp2a2O55143 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Atp2a2O55143 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Atp2a2O55143 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Atp2a2O55143 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Atp2a2O55143 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Atp2a2O55143 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Atp2a2O55143 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Atp2a2O55143 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Atp2a2O55143 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Atp2a2O55143 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Atp2a2O55143 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Atp2a2O55143 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Atp2a2O55143 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Atp2a2O55143 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Atp2a2O55143 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Atp2a2O55143 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Atp2a2O55143 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Atp2a2O55143 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Atp2a2O55143 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Atp2a2O55143 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Atp2a2O55143 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Atp2a2O55143 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Atp2a2O55143 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Atp2a2O55143 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Atp2a2O55143 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Atp2a2O55143 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Atp2a2O55143 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Atp2a2O55143 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Atp2a2O55143 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Atp2a2O55143 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Atp2a2O55143 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Atp2a2O55143 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Atp2a2O55143 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Atp2a2O55143 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Atp2a2O55143 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Atp2a2O55143 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Atp2a2O55143 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Atp2a2O55143 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Atp2a2O55143 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Atp2a2O55143 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Atp2a2O55143 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Atp2a2O55143 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Atp2a2O55143 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Atp2a2O55143 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Atp2a2O55143 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Atp2a2O55143 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Atp2a2O55143 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Atp2a2O55143 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Atp2a2O55143 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Atp2a2O55143 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Atp2a2O55143 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Atp2a2O55143 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Atp2a2O55143 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Atp2a2O55143 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Atp2a2O55143 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Atp2a2O55143 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Atp2a2O55143 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Atp2a2O55143 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Atp2a2O55143 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Atp2a2O55143 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Atp2a2O55143 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Atp2a2O55143 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Atp2a2O55143 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Atp2a2O55143 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Atp2a2O55143 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Atp2a2O55143 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Atp2a2O55143 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Atp2a2O55143 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Atp2a2O55143 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Atp2a2O55143 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Atp2a2O55143 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Atp2a2O55143 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Atp2a2O55143 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Atp2a2O55143 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Atp2a2O55143 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Atp2a2O55143 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Atp2a2O55143 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Atp2a2O55143 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Atp2a2O55143 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Atp2a2O55143 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Atp2a2O55143 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Atp2a2O55143 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Atp2a2O55143 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Atp2a2O55143 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Atp2a2O55143 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Atp2a2O55143 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Atp2a2O55143 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Atp2a2O55143 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Atp2a2O55143 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Atp2a2O55143 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Atp2a2O55143 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Atp2a2O55143 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Atp2a2O55143 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Atp2a2O55143 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Atp2a2O55143 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Atp2a2O55143 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Atp2a2O55143 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Atp2a2O55143 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Atp2a2O55143 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Atp2a2O55143 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms