Protein–RNA interactions for Protein: O55135

Eif6, Eukaryotic translation initiation factor 6, mousemouse

Predictions only

Length 245 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eif6O55135 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Eif6O55135 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Eif6O55135 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Eif6O55135 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Eif6O55135 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Eif6O55135 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Eif6O55135 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Eif6O55135 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Eif6O55135 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Eif6O55135 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Eif6O55135 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Eif6O55135 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Eif6O55135 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Eif6O55135 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Eif6O55135 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Eif6O55135 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Eif6O55135 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Eif6O55135 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Eif6O55135 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Eif6O55135 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Eif6O55135 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Eif6O55135 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Eif6O55135 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Eif6O55135 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Eif6O55135 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Eif6O55135 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Eif6O55135 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Eif6O55135 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Eif6O55135 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Eif6O55135 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Eif6O55135 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Eif6O55135 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Eif6O55135 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Eif6O55135 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Eif6O55135 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Eif6O55135 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Eif6O55135 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Eif6O55135 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Eif6O55135 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Eif6O55135 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Eif6O55135 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Eif6O55135 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Eif6O55135 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Eif6O55135 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Eif6O55135 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Eif6O55135 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Eif6O55135 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Eif6O55135 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Eif6O55135 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Eif6O55135 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Eif6O55135 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Eif6O55135 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Eif6O55135 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Eif6O55135 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Eif6O55135 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Eif6O55135 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Eif6O55135 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Eif6O55135 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Eif6O55135 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Eif6O55135 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Eif6O55135 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Eif6O55135 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Eif6O55135 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Eif6O55135 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Eif6O55135 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Eif6O55135 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Eif6O55135 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Eif6O55135 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Eif6O55135 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Eif6O55135 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Eif6O55135 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Eif6O55135 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Eif6O55135 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Eif6O55135 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Eif6O55135 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Eif6O55135 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Eif6O55135 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Eif6O55135 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Eif6O55135 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Eif6O55135 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Eif6O55135 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Eif6O55135 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Eif6O55135 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Eif6O55135 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Eif6O55135 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Eif6O55135 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Eif6O55135 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Eif6O55135 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Eif6O55135 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Eif6O55135 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Eif6O55135 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Eif6O55135 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Eif6O55135 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Eif6O55135 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Eif6O55135 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Eif6O55135 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Eif6O55135 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Eif6O55135 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Eif6O55135 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Eif6O55135 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms