Protein–RNA interactions for Protein: O55131

Sept7, Septin-7, mousemouse

Predictions only

Length 436 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sept7O55131 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sept7O55131 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sept7O55131 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sept7O55131 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sept7O55131 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sept7O55131 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sept7O55131 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sept7O55131 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sept7O55131 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sept7O55131 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sept7O55131 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sept7O55131 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sept7O55131 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sept7O55131 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sept7O55131 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Sept7O55131 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Sept7O55131 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sept7O55131 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sept7O55131 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sept7O55131 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sept7O55131 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sept7O55131 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sept7O55131 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Sept7O55131 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Sept7O55131 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Sept7O55131 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Sept7O55131 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Sept7O55131 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Sept7O55131 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sept7O55131 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Sept7O55131 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sept7O55131 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sept7O55131 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Sept7O55131 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sept7O55131 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sept7O55131 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sept7O55131 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sept7O55131 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sept7O55131 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sept7O55131 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sept7O55131 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sept7O55131 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sept7O55131 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sept7O55131 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sept7O55131 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sept7O55131 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sept7O55131 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sept7O55131 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sept7O55131 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sept7O55131 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sept7O55131 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sept7O55131 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sept7O55131 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sept7O55131 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sept7O55131 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sept7O55131 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sept7O55131 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sept7O55131 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sept7O55131 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sept7O55131 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sept7O55131 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sept7O55131 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sept7O55131 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sept7O55131 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sept7O55131 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sept7O55131 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sept7O55131 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sept7O55131 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sept7O55131 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sept7O55131 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sept7O55131 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sept7O55131 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sept7O55131 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sept7O55131 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sept7O55131 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sept7O55131 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sept7O55131 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sept7O55131 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sept7O55131 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sept7O55131 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sept7O55131 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sept7O55131 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sept7O55131 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sept7O55131 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sept7O55131 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Sept7O55131 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sept7O55131 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sept7O55131 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sept7O55131 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sept7O55131 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Sept7O55131 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sept7O55131 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sept7O55131 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Sept7O55131 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sept7O55131 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sept7O55131 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sept7O55131 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sept7O55131 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sept7O55131 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sept7O55131 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms