Protein–RNA interactions for Protein: O54956

Pole2, DNA polymerase epsilon subunit 2, mousemouse

Predictions only

Length 527 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pole2O54956 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pole2O54956 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pole2O54956 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pole2O54956 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pole2O54956 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Pole2O54956 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pole2O54956 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pole2O54956 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pole2O54956 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pole2O54956 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pole2O54956 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pole2O54956 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pole2O54956 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pole2O54956 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pole2O54956 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pole2O54956 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pole2O54956 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Pole2O54956 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Pole2O54956 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Pole2O54956 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Pole2O54956 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pole2O54956 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pole2O54956 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pole2O54956 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pole2O54956 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pole2O54956 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pole2O54956 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pole2O54956 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pole2O54956 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pole2O54956 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pole2O54956 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pole2O54956 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pole2O54956 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pole2O54956 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pole2O54956 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pole2O54956 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pole2O54956 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pole2O54956 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pole2O54956 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pole2O54956 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pole2O54956 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pole2O54956 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pole2O54956 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pole2O54956 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pole2O54956 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pole2O54956 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pole2O54956 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pole2O54956 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pole2O54956 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pole2O54956 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pole2O54956 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pole2O54956 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pole2O54956 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pole2O54956 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pole2O54956 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pole2O54956 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pole2O54956 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pole2O54956 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pole2O54956 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pole2O54956 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pole2O54956 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pole2O54956 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pole2O54956 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pole2O54956 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pole2O54956 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pole2O54956 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pole2O54956 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pole2O54956 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pole2O54956 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pole2O54956 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pole2O54956 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pole2O54956 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pole2O54956 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pole2O54956 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pole2O54956 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pole2O54956 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pole2O54956 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pole2O54956 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pole2O54956 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pole2O54956 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pole2O54956 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pole2O54956 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pole2O54956 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pole2O54956 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pole2O54956 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pole2O54956 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pole2O54956 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pole2O54956 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pole2O54956 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pole2O54956 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pole2O54956 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pole2O54956 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pole2O54956 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Pole2O54956 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pole2O54956 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pole2O54956 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pole2O54956 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pole2O54956 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pole2O54956 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Pole2O54956 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms