Protein–RNA interactions for Protein: O54951

Sema6b, Semaphorin-6B, mousemouse

Predictions only

Length 886 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema6bO54951 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Sema6bO54951 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Sema6bO54951 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Sema6bO54951 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Sema6bO54951 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Sema6bO54951 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Sema6bO54951 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Sema6bO54951 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Sema6bO54951 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Sema6bO54951 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Sema6bO54951 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Sema6bO54951 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Sema6bO54951 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Sema6bO54951 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Sema6bO54951 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Sema6bO54951 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Sema6bO54951 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Sema6bO54951 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Sema6bO54951 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Sema6bO54951 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Sema6bO54951 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Sema6bO54951 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Sema6bO54951 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Sema6bO54951 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Sema6bO54951 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Sema6bO54951 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Sema6bO54951 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Sema6bO54951 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Sema6bO54951 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Sema6bO54951 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Sema6bO54951 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Sema6bO54951 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Sema6bO54951 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Sema6bO54951 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Sema6bO54951 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Sema6bO54951 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Sema6bO54951 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Sema6bO54951 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Sema6bO54951 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Sema6bO54951 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Sema6bO54951 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Sema6bO54951 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Sema6bO54951 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Sema6bO54951 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Sema6bO54951 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Sema6bO54951 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Sema6bO54951 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Sema6bO54951 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Sema6bO54951 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Sema6bO54951 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Sema6bO54951 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Sema6bO54951 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Sema6bO54951 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Sema6bO54951 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Sema6bO54951 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Sema6bO54951 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Sema6bO54951 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Sema6bO54951 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Sema6bO54951 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Sema6bO54951 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Sema6bO54951 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Sema6bO54951 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Sema6bO54951 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Sema6bO54951 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Sema6bO54951 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Sema6bO54951 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Sema6bO54951 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Sema6bO54951 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Sema6bO54951 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Sema6bO54951 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Sema6bO54951 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Sema6bO54951 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Sema6bO54951 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Sema6bO54951 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Sema6bO54951 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Sema6bO54951 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Sema6bO54951 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Sema6bO54951 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Sema6bO54951 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Sema6bO54951 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Sema6bO54951 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Sema6bO54951 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Sema6bO54951 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Sema6bO54951 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Sema6bO54951 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Sema6bO54951 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Sema6bO54951 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Sema6bO54951 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Sema6bO54951 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Sema6bO54951 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Sema6bO54951 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Sema6bO54951 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Sema6bO54951 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Sema6bO54951 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Sema6bO54951 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Sema6bO54951 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Sema6bO54951 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Sema6bO54951 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Sema6bO54951 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Sema6bO54951 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms