Protein–RNA interactions for Protein: O54890

Itgb3, Integrin beta-3, mousemouse

Predictions only

Length 787 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb3O54890 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Itgb3O54890 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Itgb3O54890 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Itgb3O54890 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Itgb3O54890 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Itgb3O54890 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Itgb3O54890 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Itgb3O54890 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Itgb3O54890 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Itgb3O54890 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Itgb3O54890 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Itgb3O54890 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Itgb3O54890 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Itgb3O54890 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Itgb3O54890 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Itgb3O54890 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Itgb3O54890 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Itgb3O54890 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Itgb3O54890 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Itgb3O54890 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Itgb3O54890 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Itgb3O54890 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Itgb3O54890 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Itgb3O54890 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Itgb3O54890 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Itgb3O54890 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Itgb3O54890 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Itgb3O54890 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Itgb3O54890 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Itgb3O54890 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Itgb3O54890 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Itgb3O54890 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Itgb3O54890 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Itgb3O54890 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Itgb3O54890 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Itgb3O54890 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Itgb3O54890 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Itgb3O54890 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Itgb3O54890 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Itgb3O54890 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Itgb3O54890 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Itgb3O54890 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Itgb3O54890 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Itgb3O54890 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Itgb3O54890 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Itgb3O54890 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Itgb3O54890 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Itgb3O54890 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Itgb3O54890 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Itgb3O54890 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Itgb3O54890 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Itgb3O54890 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Itgb3O54890 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Itgb3O54890 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Itgb3O54890 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Itgb3O54890 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Itgb3O54890 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Itgb3O54890 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Itgb3O54890 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Itgb3O54890 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Itgb3O54890 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Itgb3O54890 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Itgb3O54890 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Itgb3O54890 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Itgb3O54890 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Itgb3O54890 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Itgb3O54890 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Itgb3O54890 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Itgb3O54890 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Itgb3O54890 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Itgb3O54890 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Itgb3O54890 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Itgb3O54890 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Itgb3O54890 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Itgb3O54890 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Itgb3O54890 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Itgb3O54890 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Itgb3O54890 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Itgb3O54890 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Itgb3O54890 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Itgb3O54890 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Itgb3O54890 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Itgb3O54890 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Itgb3O54890 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Itgb3O54890 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Itgb3O54890 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Itgb3O54890 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Itgb3O54890 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Itgb3O54890 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Itgb3O54890 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Itgb3O54890 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Itgb3O54890 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Itgb3O54890 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Itgb3O54890 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Itgb3O54890 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.46
Itgb3O54890 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Itgb3O54890 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Itgb3O54890 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Itgb3O54890 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Itgb3O54890 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms